29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4990 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  924    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  26.16 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  34.62 
 
 		 516 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  27.08 
 
 		 529 aa  99  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  26.38 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  29.79 
 
 		 510 aa  96.7  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  27.07 
 
 		 508 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  27.83 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  30.46 
 
 		 515 aa  92.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  26.94 
 
 		 505 aa  90.1  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  24.37 
 
 		 514 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  27.67 
 
 		 528 aa  87.8  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  29.46 
 
 		 536 aa  87.4  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.18 
 
 		 522 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  25.59 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  24.14 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  27.99 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  26.41 
 
 		 485 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  26.09 
 
 		 523 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  26.82 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  23.23 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  23.96 
 
 		 520 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  26.29 
 
 		 533 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  26.92 
 
 		 309 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  23.4 
 
 		 284 aa  54.7  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  24.28 
 
 		 281 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  22.08 
 
 		 277 aa  50.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  20.56 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>