37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0434 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 496 aa  1007    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  26.85 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  25.76 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.59 
 
 		 529 aa  130  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  27.3 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  23.6 
 
 		 523 aa  126  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25.95 
 
 		 516 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  23.65 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  22.52 
 
 		 514 aa  117  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  22.95 
 
 		 505 aa  116  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  22.72 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  21.8 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  22.24 
 
 		 525 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  21.59 
 
 		 524 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  33.17 
 
 		 462 aa  99.4  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  21.21 
 
 		 530 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  20.56 
 
 		 536 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  23.33 
 
 		 522 aa  83.6  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  22.32 
 
 		 492 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  23.83 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  25.86 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  20.08 
 
 		 526 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.13 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  25.88 
 
 		 309 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  26.44 
 
 		 281 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.99 
 
 		 285 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  23.66 
 
 		 284 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  24.68 
 
 		 295 aa  49.7  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  26.74 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25 
 
 		 277 aa  48.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.83 
 
 		 520 aa  47.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  24.01 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  21.85 
 
 		 315 aa  44.7  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  27.54 
 
 		 658 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  25.19 
 
 		 310 aa  44.7  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  27.15 
 
 		 281 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>