38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1920 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  100 
 
 		 492 aa  959    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  42.71 
 
 		 522 aa  323  5e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  31.59 
 
 		 510 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  28.88 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  30.98 
 
 		 536 aa  183  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  31.53 
 
 		 530 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  31.47 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  31.66 
 
 		 524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  30.68 
 
 		 514 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  28.22 
 
 		 497 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  31.93 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  27.79 
 
 		 505 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  25.4 
 
 		 476 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  29.68 
 
 		 528 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2971  eight transmembrane protein EpsH  33.72 
 
 		 485 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  22.31 
 
 		 496 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  32.95 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.19 
 
 		 526 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  30.8 
 
 		 281 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  24.45 
 
 		 525 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  25.79 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.61 
 
 		 520 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0140  hypothetical protein  22.63 
 
 		 508 aa  70.1  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  26.53 
 
 		 516 aa  69.7  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  21.64 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  31.4 
 
 		 312 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  26.25 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  21.53 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  21.74 
 
 		 534 aa  56.6  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  26.8 
 
 		 331 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  29.59 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  29.09 
 
 		 309 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  23.28 
 
 		 318 aa  50.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  32 
 
 		 658 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4990  hypothetical protein  23.28 
 
 		 462 aa  47.8  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  25.71 
 
 		 285 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  28.37 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2199  eight transmembrane protein EpsH  28.3 
 
 		 277 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>