43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0284 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  100 
 
 		 658 aa  1298    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  32.84 
 
 		 290 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  26.52 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  25.21 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  32.8 
 
 		 309 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2023  hypothetical protein  26.18 
 
 		 295 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.516883  normal  0.703476 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  30.17 
 
 		 528 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  34.34 
 
 		 530 aa  68.2  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0140  eight transmembrane protein EpsH  36.44 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  28.73 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  28.21 
 
 		 515 aa  65.9  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2513  exosortase 1  31.37 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.356158  normal  0.155527 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  31.85 
 
 		 331 aa  64.3  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  28.44 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27.43 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.98 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  28.78 
 
 		 310 aa  62  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02596  eight transmembrane protein EpsH  25.76 
 
 		 476 aa  62  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.454303  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  32.87 
 
 		 284 aa  62  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  27.67 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  31.08 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  31.47 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  28.21 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  29.73 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  30.81 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  29.55 
 
 		 516 aa  60.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  30.41 
 
 		 281 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  28.9 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  27.38 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1920  ABC transporter related  30.06 
 
 		 492 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  29.1 
 
 		 542 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0434  eight transmembrane protein EpsH  25.85 
 
 		 496 aa  54.7  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1469  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  54.7  0.000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.498929 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  22.58 
 
 		 533 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  25.79 
 
 		 526 aa  53.9  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1173  eight transmembrane protein EpsH  27.86 
 
 		 497 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  31.58 
 
 		 281 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0720  hypothetical protein  26.83 
 
 		 318 aa  52.4  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.736593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  30.77 
 
 		 298 aa  50.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  26.42 
 
 		 516 aa  48.5  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0581  hypothetical protein  33.65 
 
 		 291 aa  48.5  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.914687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  27.04 
 
 		 213 aa  47  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0183  putative lipoprotein  32.97 
 
 		 2204 aa  46.6  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>