36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3270 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3270  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1093    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.186026  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2585  eight transmembrane protein EpsH  22.4 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3384  transmembrane exosortase  25 
 
 		 533 aa  75.1  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1503  hypothetical protein  22.9 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2406  hypothetical protein  25.72 
 
 		 505 aa  71.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.150586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2367  eight transmembrane protein EpsH  27.2 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2443  eight transmembrane protein EpsH  24.73 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00230441  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2581  EpsI family protein  31.15 
 
 		 516 aa  65.1  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0666  hypothetical protein  25.18 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1803  eight transmembrane protein EpsH  28.63 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3054  eight transmembrane protein EpsH  25.39 
 
 		 309 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1021  hypothetical protein  30 
 
 		 213 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0954  eight transmembrane protein EpsH  29.11 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2003  hypothetical protein  23.38 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0672  eight transmembrane protein EpsH  25.86 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1470  eight transmembrane protein EpsH  24.59 
 
 		 315 aa  57.4  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.537051 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2447  eight transmembrane protein EpsH  28.4 
 
 		 281 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3885  hypothetical protein  37.5 
 
 		 550 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.315929  normal  0.0708866 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1979  hypothetical protein  24.9 
 
 		 290 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2342  eight transmembrane protein EpsH  27.14 
 
 		 277 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2528  hypothetical protein  31.16 
 
 		 358 aa  55.1  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.192695 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4271  hypothetical protein  22.01 
 
 		 534 aa  53.9  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.331154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2521  hypothetical protein  24.35 
 
 		 529 aa  52  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.630268  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0290  hypothetical protein  22.55 
 
 		 515 aa  51.6  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0847  hypothetical protein  25.49 
 
 		 281 aa  51.6  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0246  hypothetical protein  26.9 
 
 		 304 aa  51.6  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2352  exosortase 2  29.05 
 
 		 310 aa  51.2  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1978  hypothetical protein  24.18 
 
 		 510 aa  50.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2328  hypothetical protein  25.39 
 
 		 522 aa  50.8  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338173  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0284  eight transmembrane protein EpsH  28.57 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3270  exosortase 1  22.61 
 
 		 536 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1792  hypothetical protein  25.66 
 
 		 298 aa  46.6  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3120  hypothetical protein  32.77 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548288  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1514  eight transmembrane protein EpsH  23.08 
 
 		 530 aa  45.1  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0189449  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2394  hypothetical protein  25.21 
 
 		 525 aa  45.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1624  eight transmembrane protein EpsH  25.27 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.201479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>