More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1828 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 		 443 aa  911    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  67.21 
 
 		 434 aa  640    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  67.6 
 
 		 431 aa  632  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 		 458 aa  520  1e-146  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  54.83 
 
 		 452 aa  511  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  55.63 
 
 		 438 aa  500  1e-140  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  46.8 
 
 		 439 aa  405  1e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  45.98 
 
 		 440 aa  390  1e-107  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  37.14 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  37.14 
 
 		 460 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  36.87 
 
 		 455 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  37.2 
 
 		 461 aa  282  1e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.02 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  39.18 
 
 		 474 aa  280  5e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  36.46 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  39 
 
 		 471 aa  275  8e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  36.74 
 
 		 460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  39.41 
 
 		 472 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  36.64 
 
 		 462 aa  274  3e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  38.98 
 
 		 471 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  37.83 
 
 		 461 aa  273  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 		 462 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  36.26 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  36.92 
 
 		 462 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  36.7 
 
 		 462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  36.82 
 
 		 460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  40.49 
 
 		 463 aa  270  5e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  37.06 
 
 		 459 aa  270  5e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  37.29 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  35.71 
 
 		 460 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  37.34 
 
 		 459 aa  269  7e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  38 
 
 		 466 aa  269  8e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  36.54 
 
 		 460 aa  266  4e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 		 466 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  36.25 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  36.68 
 
 		 464 aa  263  6e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  36.15 
 
 		 461 aa  263  6e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  36.48 
 
 		 460 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  37.2 
 
 		 463 aa  261  1e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  36.15 
 
 		 460 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 		 466 aa  261  2e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  36.09 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  39.23 
 
 		 469 aa  259  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.95 
 
 		 472 aa  257  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  36.43 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  35.91 
 
 		 506 aa  254  1.0000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  35.75 
 
 		 470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  38 
 
 		 440 aa  253  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  35.54 
 
 		 460 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  34.66 
 
 		 472 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  35.56 
 
 		 467 aa  251  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  34.69 
 
 		 508 aa  251  2e-65  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.160397 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  33.9 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  36.36 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  35.56 
 
 		 467 aa  249  5e-65  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  35.42 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  36.34 
 
 		 466 aa  249  9e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  35.56 
 
 		 467 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  35.11 
 
 		 467 aa  249  1e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  34.87 
 
 		 466 aa  246  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  38.59 
 
 		 479 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  36.62 
 
 		 460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.882903 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  35.82 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  36.24 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  36.01 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  35.55 
 
 		 475 aa  236  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  34.29 
 
 		 477 aa  235  9e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  27.86 
 
 		 440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  29.62 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  28.66 
 
 		 440 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  28.91 
 
 		 435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  25.91 
 
 		 439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  27.1 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  26.56 
 
 		 431 aa  127  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  28.53 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  26.47 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  28.53 
 
 		 435 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  28.98 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  25.27 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  28.3 
 
 		 435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  25.59 
 
 		 434 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  26.86 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  24.63 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  26.01 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  25.36 
 
 		 434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  24.87 
 
 		 438 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  27 
 
 		 434 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  26.59 
 
 		 443 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  24.94 
 
 		 437 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  26.81 
 
 		 441 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  25.91 
 
 		 438 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  26.29 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  24.6 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  25.87 
 
 		 452 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  28.47 
 
 		 445 aa  116  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  27.04 
 
 		 442 aa  116  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  25.87 
 
 		 452 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  28.02 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  28.14 
 
 		 445 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  27.82 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>