More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0424 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
440 aa  885    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  55.53 
 
 
466 aa  479  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  54.46 
 
 
464 aa  472  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  53.78 
 
 
461 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  52.86 
 
 
462 aa  463  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  54.52 
 
 
463 aa  462  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  51.97 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.78 
 
 
459 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  52.07 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  53.62 
 
 
460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  52.2 
 
 
460 aa  448  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.15 
 
 
466 aa  450  1e-125  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  52.55 
 
 
460 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  52.42 
 
 
460 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  52.3 
 
 
470 aa  446  1.0000000000000001e-124  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  52.46 
 
 
458 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  50.57 
 
 
460 aa  439  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  50.93 
 
 
462 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  50.46 
 
 
462 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  52.7 
 
 
477 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  50.93 
 
 
472 aa  437  1e-121  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  50.23 
 
 
462 aa  435  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  50.23 
 
 
462 aa  436  1e-121  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  47.03 
 
 
505 aa  434  1e-120  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  52.48 
 
 
477 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  49.77 
 
 
464 aa  434  1e-120  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  50.9 
 
 
472 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  52.03 
 
 
475 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  51.04 
 
 
469 aa  430  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  49.54 
 
 
459 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  49.65 
 
 
460 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  49.65 
 
 
460 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  51.14 
 
 
471 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  49.31 
 
 
460 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.96 
 
 
459 aa  418  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  49.44 
 
 
471 aa  415  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  49.19 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  46.61 
 
 
507 aa  411  1e-114  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  45.98 
 
 
515 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  50.11 
 
 
479 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  49.55 
 
 
474 aa  414  1e-114  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  49.66 
 
 
471 aa  413  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  48.27 
 
 
463 aa  414  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  46.53 
 
 
508 aa  411  1e-113  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  46.74 
 
 
506 aa  411  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  48.27 
 
 
455 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.49 
 
 
455 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  49.54 
 
 
467 aa  403  1e-111  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  49.54 
 
 
467 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  46.4 
 
 
454 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  48.38 
 
 
467 aa  396  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  47.58 
 
 
461 aa  396  1e-109  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  49.07 
 
 
467 aa  395  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  47.86 
 
 
460 aa  390  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  46.33 
 
 
466 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  46 
 
 
463 aa  381  1e-104  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  45.01 
 
 
461 aa  381  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  46.24 
 
 
477 aa  369  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  46.3 
 
 
466 aa  356  5e-97  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  38 
 
 
443 aa  253  6e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  37.27 
 
 
434 aa  248  1e-64  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  38.98 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  38.29 
 
 
431 aa  243  6e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  37.69 
 
 
458 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  37.44 
 
 
452 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  38.36 
 
 
439 aa  227  4e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  36 
 
 
440 aa  210  4e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  32.08 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  32.87 
 
 
438 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  31.89 
 
 
440 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2933  ATPase FliI/YscN  32.87 
 
 
443 aa  150  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.13 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  29.81 
 
 
451 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  30.79 
 
 
442 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  31.34 
 
 
437 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  29.85 
 
 
438 aa  145  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  30.75 
 
 
451 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  30.21 
 
 
445 aa  143  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  29.95 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.47 
 
 
437 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1290  FliI/YscN family ATPase  31.68 
 
 
432 aa  141  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.490407  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  30 
 
 
439 aa  140  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  31.35 
 
 
449 aa  141  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  30.92 
 
 
435 aa  141  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  30.53 
 
 
438 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  29.47 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  29.3 
 
 
452 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  28.85 
 
 
431 aa  140  6e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  29.95 
 
 
445 aa  139  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  29.91 
 
 
460 aa  139  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  30.2 
 
 
452 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  30.08 
 
 
452 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  29.49 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  29.49 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1495  flagellum-specific ATP synthase  30.66 
 
 
435 aa  139  1e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  29.49 
 
 
451 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  32.53 
 
 
435 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  27.14 
 
 
442 aa  138  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  29.19 
 
 
436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  31.4 
 
 
434 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>