More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0341 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0341  V-type ATP synthase subunit B  100 
 
 
472 aa  949    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0288  V-type ATP synthase subunit B  60.44 
 
 
461 aa  565  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0066  V-type ATP synthase subunit B  57.49 
 
 
464 aa  555  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1261  H(+)-transporting two-sector ATPase  60.18 
 
 
459 aa  555  1e-157  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0368  V-type ATP synthase subunit B  57.96 
 
 
462 aa  550  1e-155  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1631  ATP synthase, B subunit  57.49 
 
 
463 aa  545  1e-154  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.882164  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1614  V-type ATP synthase subunit B  57.96 
 
 
462 aa  545  1e-154  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.233544  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1608  V-type ATP synthase subunit B  59.47 
 
 
463 aa  546  1e-154  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0548  V-type ATP synthase subunit B  58.41 
 
 
462 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2676  V-type ATP synthase subunit B  57.24 
 
 
464 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2344  V-type ATP synthase subunit B  57.24 
 
 
462 aa  541  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.294123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0299  V-type ATP synthase subunit B  57.96 
 
 
462 aa  544  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1184  V-type ATP synthase subunit B  57.89 
 
 
460 aa  542  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.403959  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0859  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.65 
 
 
472 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0698  V-type ATP synthase subunit B  55.77 
 
 
467 aa  540  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000895751 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1454  H(+)-transporting two-sector ATPase  58.15 
 
 
466 aa  535  1e-151  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.296827  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1685  V-type ATP synthase subunit B  57.65 
 
 
455 aa  538  1e-151  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0209  V-type ATP synthase subunit B  55.56 
 
 
467 aa  535  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0342  V-type ATP synthase subunit B  56.22 
 
 
477 aa  535  1e-151  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0237  V-type ATP synthase subunit B  55.34 
 
 
467 aa  531  1e-150  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.177581 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1690  V-type ATP synthase subunit B  56.73 
 
 
461 aa  534  1e-150  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.584276 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1918  V-type ATP synthase subunit B  56.17 
 
 
466 aa  533  1e-150  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0383296  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1264  V-type ATP synthase subunit B  55.12 
 
 
467 aa  533  1e-150  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0385  V-type ATP synthase subunit B  55.6 
 
 
460 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0962  H(+)-transporting two-sector ATPase  57.27 
 
 
466 aa  530  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.340532  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1769  V-type ATP synthase subunit B  54.2 
 
 
469 aa  528  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1244  V-type ATP synthase subunit B  55.6 
 
 
460 aa  529  1e-149  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1889  V-type ATP synthase subunit B  57.62 
 
 
460 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1608  V-type ATP synthase subunit B  57.62 
 
 
460 aa  528  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0403473  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1223  V-type ATP synthase subunit B  56.36 
 
 
458 aa  528  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.433042 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1500  V-type ATP synthase subunit B  57.49 
 
 
460 aa  525  1e-148  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0257  H(+)-transporting two-sector ATPase  56.61 
 
 
459 aa  524  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3071  V-type ATP synthase subunit B  55.51 
 
 
460 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3354  ATP synthase, B subunit  56.92 
 
 
471 aa  518  1e-146  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1370  ATP synthase, B subunit  56.43 
 
 
472 aa  520  1e-146  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.616766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2363  V-type ATP synthase subunit B  57.08 
 
 
459 aa  520  1e-146  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19390  V-type ATP synthase subunit B  57.3 
 
 
463 aa  517  1.0000000000000001e-145  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1101  V-type ATP synthase subunit B  55.13 
 
 
460 aa  514  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3441  V-type ATP synthase subunit B  54.08 
 
 
461 aa  508  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0282  V-type ATP synthase subunit B  54.47 
 
 
474 aa  506  9.999999999999999e-143  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.280048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1282  V-type ATP synthase subunit B  54.37 
 
 
471 aa  506  9.999999999999999e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.450927  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1758  V-type ATP synthase subunit B  56.57 
 
 
466 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2268  V-type ATP synthase subunit B  55.07 
 
 
460 aa  503  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1438  V-type ATP synthase subunit B  53.85 
 
 
471 aa  491  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.108081  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2082  V-type ATP synthase subunit B  53.54 
 
 
479 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.75116  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24978  predicted protein  50.98 
 
 
506 aa  488  1e-137  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2046  V-type ATP synthase subunit B  53.54 
 
 
470 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06232  Vacuolar ATP synthase subunit B Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9P495]  49.89 
 
 
507 aa  483  1e-135  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000329525  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01180  vacuolar ATP synthase, putative  49.05 
 
 
515 aa  472  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.204293  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_88387  F-ATPase family transporter: protons (vacuolar)  50.32 
 
 
505 aa  474  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116254  normal  0.503853 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48891  Vacuolar ATP synthase subunit B (V-ATPase B subunit) (Vacuolar proton pump B subunit) (V-ATPase 57 kDa subunit)  49.05 
 
 
508 aa  474  1e-132  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.160397 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0516  H(+)-transporting two-sector ATPase  51.7 
 
 
455 aa  471  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2563  V-type ATP synthase subunit B  53.81 
 
 
460 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.882903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1010  V-type ATP synthase subunit B  48.78 
 
 
454 aa  456  1e-127  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2667  V-type ATP synthase subunit B  52.9 
 
 
477 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2762  V-type ATP synthase subunit B  52.77 
 
 
477 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.161135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1203  V-type ATP synthase subunit B  52.55 
 
 
475 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0666697  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3463  H(+)-transporting two-sector ATPase  48.01 
 
 
466 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.194149  normal  0.374763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0424  V-type ATP synthase subunit B  49.19 
 
 
440 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0581  V-type ATP synthase subunit B  36.28 
 
 
438 aa  266  8e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2894  V-type ATP synthase subunit B  35.37 
 
 
458 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0626827  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3226  V-type ATP synthase subunit B  34.6 
 
 
452 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0093  V-type ATP synthase subunit B  34.66 
 
 
434 aa  257  4e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1682  V-type ATP synthase subunit B  35.79 
 
 
431 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.124327  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1828  V-type ATP synthase subunit B  34.66 
 
 
443 aa  252  1e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1804  V-type ATP synthase subunit B  35.1 
 
 
439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1551  H+transporting two-sector ATPase alpha/beta subunit central region  37.19 
 
 
440 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  30.41 
 
 
427 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  29.77 
 
 
438 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  34.43 
 
 
434 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  31.48 
 
 
445 aa  160  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  31.2 
 
 
445 aa  160  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  34.19 
 
 
439 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  31.6 
 
 
436 aa  159  7e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  32.53 
 
 
442 aa  159  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  35.9 
 
 
436 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  30.16 
 
 
463 aa  159  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  33.44 
 
 
439 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  31.28 
 
 
443 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  30.83 
 
 
440 aa  158  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  33.12 
 
 
439 aa  158  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  31.2 
 
 
445 aa  157  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  32.93 
 
 
437 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  30.48 
 
 
458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  33.44 
 
 
439 aa  157  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  32.75 
 
 
441 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  33.12 
 
 
443 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  30.45 
 
 
438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  30.44 
 
 
435 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  29.92 
 
 
438 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  34.1 
 
 
470 aa  153  8e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  33.77 
 
 
489 aa  153  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  29.89 
 
 
437 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  31.33 
 
 
437 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  32.62 
 
 
460 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  30.37 
 
 
434 aa  152  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  36.4 
 
 
472 aa  151  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  33.43 
 
 
436 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  28.94 
 
 
480 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  30.9 
 
 
435 aa  150  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>