More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0852 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
442 aa  885    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  65.59 
 
 
437 aa  567  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  63 
 
 
437 aa  559  1e-158  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  62.5 
 
 
437 aa  544  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  60.79 
 
 
439 aa  541  1e-153  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  60.52 
 
 
441 aa  531  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  61.2 
 
 
431 aa  525  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  58.94 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  58.84 
 
 
443 aa  512  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  61.76 
 
 
436 aa  508  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  58.96 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  59.26 
 
 
442 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  59.11 
 
 
443 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.47 
 
 
433 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  57.44 
 
 
441 aa  494  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  56.18 
 
 
434 aa  497  1e-139  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  56.52 
 
 
438 aa  495  1e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  56.05 
 
 
434 aa  497  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  58.27 
 
 
426 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  56.85 
 
 
443 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  59.67 
 
 
436 aa  494  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  57.14 
 
 
432 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  56.04 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  57.28 
 
 
441 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  56.29 
 
 
454 aa  488  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  55.79 
 
 
439 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  58.51 
 
 
422 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  56.06 
 
 
434 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  57.38 
 
 
489 aa  477  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  57.18 
 
 
434 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  53.72 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  51.85 
 
 
449 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  54.76 
 
 
442 aa  448  1e-125  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.02 
 
 
474 aa  450  1e-125  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  53.85 
 
 
441 aa  450  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  54.37 
 
 
440 aa  449  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  54.1 
 
 
440 aa  448  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  55.86 
 
 
439 aa  451  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  53.98 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.64 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  51.17 
 
 
485 aa  436  1e-121  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  51.05 
 
 
438 aa  438  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  52.31 
 
 
434 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  51.61 
 
 
440 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  51.7 
 
 
468 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 
435 aa  434  1e-120  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  53.32 
 
 
441 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  53.41 
 
 
437 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  51.17 
 
 
440 aa  428  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.98 
 
 
443 aa  429  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  54.17 
 
 
449 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.83 
 
 
449 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  46.9 
 
 
504 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 
452 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 
448 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.65 
 
 
452 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.65 
 
 
480 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  52.97 
 
 
450 aa  420  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  48.6 
 
 
463 aa  419  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.63 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  49.42 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.12 
 
 
459 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.57 
 
 
458 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
465 aa  415  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  48.16 
 
 
472 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.42 
 
 
460 aa  412  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.61 
 
 
451 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  48.61 
 
 
451 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  48.49 
 
 
451 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  48.49 
 
 
452 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  50.49 
 
 
446 aa  408  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  51.48 
 
 
446 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  48.49 
 
 
451 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  53.01 
 
 
435 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  51.22 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  47.61 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.49 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  49.18 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  50.61 
 
 
446 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  50.84 
 
 
444 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  48.49 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.36 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.47 
 
 
462 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  50.85 
 
 
442 aa  404  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  47.32 
 
 
446 aa  402  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  45.49 
 
 
471 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  47.65 
 
 
472 aa  405  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  47.32 
 
 
454 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.38 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  50.48 
 
 
439 aa  404  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  51.08 
 
 
461 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  51.08 
 
 
461 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  51.06 
 
 
458 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  48.93 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  49.64 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  48.6 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  48.84 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.91 
 
 
448 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  48.23 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  46.86 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>