More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31190 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  100 
 
 
459 aa  883    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  69.93 
 
 
446 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  69.23 
 
 
446 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  64.4 
 
 
453 aa  508  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  62.47 
 
 
439 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  61.65 
 
 
435 aa  493  9.999999999999999e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  59.25 
 
 
439 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.51 
 
 
437 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  53.1 
 
 
437 aa  446  1.0000000000000001e-124  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  58.63 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  51.79 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  55.37 
 
 
433 aa  438  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  53.65 
 
 
454 aa  433  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  51.2 
 
 
438 aa  430  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.2 
 
 
427 aa  429  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  54.76 
 
 
436 aa  431  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  49.42 
 
 
437 aa  431  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  50.12 
 
 
439 aa  431  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  49.28 
 
 
431 aa  425  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  50.47 
 
 
437 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  51.55 
 
 
442 aa  421  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  49.5 
 
 
434 aa  419  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  51.28 
 
 
441 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  51.49 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  54.72 
 
 
489 aa  416  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.32 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  51.12 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  49.41 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.29 
 
 
422 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  52.18 
 
 
441 aa  411  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  50.72 
 
 
443 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  51.77 
 
 
463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.87 
 
 
449 aa  403  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  47.7 
 
 
434 aa  402  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  50.11 
 
 
468 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  48.72 
 
 
504 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.3 
 
 
441 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  47.64 
 
 
442 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  54.25 
 
 
436 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.81 
 
 
443 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.16 
 
 
433 aa  393  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  51.91 
 
 
437 aa  394  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  51.07 
 
 
441 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  48.92 
 
 
438 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  48.79 
 
 
443 aa  388  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.83 
 
 
435 aa  389  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  49.76 
 
 
438 aa  390  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  53.05 
 
 
441 aa  387  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 
448 aa  388  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  51.05 
 
 
440 aa  385  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  47.59 
 
 
434 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  47.36 
 
 
434 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  48.83 
 
 
439 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  48.33 
 
 
443 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  50.12 
 
 
440 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  52.27 
 
 
441 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.72 
 
 
434 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
446 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  49.65 
 
 
440 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.53 
 
 
474 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  51.55 
 
 
441 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.36 
 
 
451 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  51.22 
 
 
446 aa  381  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  52.37 
 
 
440 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  50.79 
 
 
440 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  49.03 
 
 
452 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  50.74 
 
 
446 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.87 
 
 
458 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  51.12 
 
 
458 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.92 
 
 
445 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
451 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  52.97 
 
 
443 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  47.85 
 
 
449 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.62 
 
 
452 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
451 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  48.24 
 
 
451 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.76 
 
 
439 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  47.86 
 
 
452 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
456 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.87 
 
 
461 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
451 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  52.96 
 
 
441 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  50.49 
 
 
446 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.87 
 
 
462 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  51.41 
 
 
454 aa  374  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  50.9 
 
 
441 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  50.87 
 
 
458 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50.73 
 
 
458 aa  374  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  49.29 
 
 
446 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.87 
 
 
461 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
448 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  47.98 
 
 
432 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  48.59 
 
 
478 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  45.61 
 
 
472 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  47.42 
 
 
468 aa  371  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  50.65 
 
 
441 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  48.7 
 
 
465 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  48.25 
 
 
552 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
446 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  52.97 
 
 
443 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>