More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1823 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  88.41 
 
 		 440 aa  786    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  80.68 
 
 		 441 aa  732    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  93.2 
 
 		 441 aa  838    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  90.02 
 
 		 441 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  93.2 
 
 		 441 aa  832    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  83.03 
 
 		 454 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 441 aa  892    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  70.64 
 
 		 445 aa  631  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  71.4 
 
 		 450 aa  623  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  71.06 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  70.37 
 
 		 451 aa  617  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  70.6 
 
 		 451 aa  617  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  71.1 
 
 		 453 aa  616  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  70.23 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  64.52 
 
 		 475 aa  548  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  61.76 
 
 		 445 aa  528  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  59.96 
 
 		 448 aa  525  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  53.01 
 
 		 455 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  51.39 
 
 		 433 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  51.21 
 
 		 437 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.79 
 
 		 422 aa  409  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.47 
 
 		 431 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.84 
 
 		 426 aa  408  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.55 
 
 		 450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  49.04 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 		 454 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  48.59 
 
 		 437 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  49.64 
 
 		 437 aa  398  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  52.4 
 
 		 436 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  46.56 
 
 		 439 aa  395  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  50.24 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  48.67 
 
 		 442 aa  394  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  46.57 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  50.95 
 
 		 453 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  49.89 
 
 		 441 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  46.33 
 
 		 435 aa  385  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.58 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  48.72 
 
 		 442 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.45 
 
 		 449 aa  385  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  50.99 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  46.46 
 
 		 443 aa  386  1e-106  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.98 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.81 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.92 
 
 		 474 aa  378  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  47.64 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.1 
 
 		 463 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  46.96 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  50.9 
 
 		 459 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.98 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  46.6 
 
 		 443 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  46.32 
 
 		 427 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  48.49 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  47.25 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  47.16 
 
 		 434 aa  369  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  47.71 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  48.28 
 
 		 440 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  49.41 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.86 
 
 		 439 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  46.21 
 
 		 434 aa  368  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  46.15 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  47.38 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  47.38 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  46.92 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.5 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  48.84 
 
 		 437 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  48 
 
 		 468 aa  363  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  42.89 
 
 		 436 aa  363  4e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  45.39 
 
 		 443 aa  362  8e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  46.79 
 
 		 438 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  47.26 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  47.25 
 
 		 442 aa  360  3e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  43.28 
 
 		 450 aa  359  7e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  46.12 
 
 		 444 aa  358  7e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 		 439 aa  358  8e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  45.45 
 
 		 435 aa  358  8e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.47 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.24 
 
 		 448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.97 
 
 		 460 aa  356  5e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  49.74 
 
 		 446 aa  355  6.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  44.8 
 
 		 446 aa  355  7.999999999999999e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  44.98 
 
 		 440 aa  354  1e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  44.89 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.35 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  47.37 
 
 		 458 aa  352  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  44.13 
 
 		 458 aa  351  2e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  44.89 
 
 		 440 aa  350  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  46.09 
 
 		 487 aa  350  3e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  44.9 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  44.49 
 
 		 464 aa  349  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  46.64 
 
 		 514 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  46.42 
 
 		 552 aa  349  5e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  46.64 
 
 		 513 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  46.64 
 
 		 513 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  46.68 
 
 		 513 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  46.76 
 
 		 513 aa  348  8e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  44.42 
 
 		 472 aa  348  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  46.64 
 
 		 519 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  46.42 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  46.52 
 
 		 472 aa  348  1e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>