More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1653 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
453 aa  878    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  65.48 
 
 
439 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  63.57 
 
 
446 aa  518  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  63.16 
 
 
439 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  64.4 
 
 
459 aa  508  9.999999999999999e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  61.59 
 
 
435 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  60.33 
 
 
435 aa  478  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  58.8 
 
 
446 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  57.18 
 
 
433 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.32 
 
 
489 aa  443  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.64 
 
 
439 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.24 
 
 
437 aa  432  1e-120  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  56.42 
 
 
436 aa  434  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  50.72 
 
 
437 aa  428  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  52.9 
 
 
434 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  54 
 
 
443 aa  431  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  49.04 
 
 
431 aa  427  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  48.26 
 
 
437 aa  425  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  48.96 
 
 
438 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.01 
 
 
450 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  53.85 
 
 
454 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  52.77 
 
 
441 aa  423  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  49.18 
 
 
437 aa  421  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.76 
 
 
433 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.4 
 
 
422 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  54.31 
 
 
436 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  53.07 
 
 
437 aa  419  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  49.05 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  50.36 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  55.34 
 
 
436 aa  414  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  50 
 
 
441 aa  410  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  49.53 
 
 
434 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  50.59 
 
 
443 aa  408  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  51.2 
 
 
440 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 
434 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
443 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  50.61 
 
 
434 aa  409  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  52.52 
 
 
441 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.18 
 
 
443 aa  406  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  51.97 
 
 
441 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  52.16 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.61 
 
 
442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  51.9 
 
 
445 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  47.14 
 
 
442 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  50.34 
 
 
468 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  47.38 
 
 
504 aa  402  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  51.76 
 
 
441 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  49.4 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  48.24 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  49.31 
 
 
438 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.24 
 
 
438 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.72 
 
 
474 aa  398  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  51.17 
 
 
441 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  50.95 
 
 
441 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  51.07 
 
 
440 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  49.16 
 
 
449 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  48.65 
 
 
463 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  51.99 
 
 
452 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  51.41 
 
 
453 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  50.95 
 
 
441 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  52.26 
 
 
441 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  52.11 
 
 
451 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.2 
 
 
441 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  48.17 
 
 
440 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  52.11 
 
 
451 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.39 
 
 
480 aa  386  1e-106  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  52.01 
 
 
450 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  47.66 
 
 
432 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  48.8 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  47.03 
 
 
439 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  48.8 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  47.26 
 
 
439 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  47.71 
 
 
439 aa  384  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  47.78 
 
 
446 aa  382  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
446 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  50.12 
 
 
448 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.26 
 
 
439 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  51.29 
 
 
451 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  49.4 
 
 
458 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  47.88 
 
 
446 aa  381  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  47.09 
 
 
446 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  48.91 
 
 
445 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.01 
 
 
434 aa  376  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  46.65 
 
 
440 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 
449 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.18 
 
 
445 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.37 
 
 
443 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.45 
 
 
464 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  46.39 
 
 
440 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1391  ATPase FliI/YscN  55.79 
 
 
452 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00127996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  47.48 
 
 
446 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>