More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3911 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  80.91 
 
 		 441 aa  734    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 441 aa  887    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  89.34 
 
 		 441 aa  810    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  96.37 
 
 		 441 aa  854    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  83.71 
 
 		 454 aa  764    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  87.73 
 
 		 440 aa  781    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  93.2 
 
 		 441 aa  838    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  72.49 
 
 		 453 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  69.72 
 
 		 445 aa  624  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  72.54 
 
 		 450 aa  624  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  71.4 
 
 		 452 aa  619  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  71.33 
 
 		 451 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  71.1 
 
 		 451 aa  616  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  71.03 
 
 		 451 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  64.52 
 
 		 475 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  62.44 
 
 		 445 aa  536  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  59.51 
 
 		 448 aa  522  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  52.07 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  50.58 
 
 		 433 aa  418  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.58 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  50.61 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  52.71 
 
 		 450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.24 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  48.44 
 
 		 437 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  51.17 
 
 		 453 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  51.68 
 
 		 436 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.58 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  48.63 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  48.01 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.52 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  45.85 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  49.05 
 
 		 437 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  44.62 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  49.16 
 
 		 436 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.68 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.35 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  45.85 
 
 		 435 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  47.63 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  49.51 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.48 
 
 		 474 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  49.39 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  45.08 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  48.5 
 
 		 489 aa  373  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  48.1 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  52.96 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  46.3 
 
 		 432 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  46 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  47.6 
 
 		 438 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.27 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  47.04 
 
 		 443 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  47.89 
 
 		 441 aa  371  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  48.83 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 		 437 aa  371  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.27 
 
 		 443 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  47.36 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  44.55 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  47.13 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  46.45 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  45.71 
 
 		 463 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  46.34 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  46.57 
 
 		 465 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.49 
 
 		 466 aa  364  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  47.99 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  44.98 
 
 		 442 aa  363  2e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  46.21 
 
 		 434 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  46.44 
 
 		 442 aa  363  4e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  48.81 
 
 		 439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.97 
 
 		 460 aa  362  6e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  46.45 
 
 		 439 aa  362  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.7 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  46.48 
 
 		 444 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.6 
 
 		 448 aa  358  9e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  43.28 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  44.83 
 
 		 443 aa  358  9.999999999999999e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  42.89 
 
 		 436 aa  357  1.9999999999999998e-97  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  46.89 
 
 		 439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  50.99 
 
 		 446 aa  356  5e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  44.87 
 
 		 504 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  45.87 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  44.44 
 
 		 446 aa  355  1e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  48.96 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  44.6 
 
 		 458 aa  354  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  45.58 
 
 		 440 aa  353  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  45.24 
 
 		 440 aa  352  5.9999999999999994e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  44.52 
 
 		 435 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  43.88 
 
 		 464 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  48.11 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.35 
 
 		 439 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  46.35 
 
 		 487 aa  349  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  47.13 
 
 		 446 aa  350  4e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  44.9 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  46.52 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  42.59 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  49.28 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  45.9 
 
 		 442 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  45.71 
 
 		 552 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  44.63 
 
 		 435 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.73 
 
 		 509 aa  344  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  45.5 
 
 		 513 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>