More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2344 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
439 aa  854    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  67.14 
 
 
439 aa  553  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  63.16 
 
 
453 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  67.54 
 
 
435 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  64.3 
 
 
435 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  59.25 
 
 
459 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  59.53 
 
 
446 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  55.84 
 
 
446 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  53.27 
 
 
439 aa  442  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  56.32 
 
 
436 aa  438  9.999999999999999e-123  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  51.95 
 
 
437 aa  436  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  50.81 
 
 
438 aa  434  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  48.18 
 
 
437 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
426 aa  434  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  54.72 
 
 
433 aa  433  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.82 
 
 
427 aa  430  1e-119  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  54.83 
 
 
489 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  57.61 
 
 
436 aa  431  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  49.88 
 
 
431 aa  425  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
434 aa  427  1e-118  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  53.75 
 
 
441 aa  426  1e-118  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  53.48 
 
 
442 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  54.78 
 
 
436 aa  423  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 
437 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.81 
 
 
422 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  50.23 
 
 
434 aa  423  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  55.61 
 
 
454 aa  422  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  52.67 
 
 
437 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  52.21 
 
 
443 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  55.4 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  50.58 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  55.01 
 
 
434 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  51.63 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.72 
 
 
438 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.46 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  49.18 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  48.31 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.12 
 
 
433 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  52.53 
 
 
441 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  49.42 
 
 
434 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  49.76 
 
 
440 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.08 
 
 
438 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  49.54 
 
 
443 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.82 
 
 
435 aa  395  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  49.54 
 
 
443 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.98 
 
 
450 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  53.4 
 
 
435 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  49.52 
 
 
440 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  52.1 
 
 
439 aa  391  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  49.4 
 
 
440 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  49.06 
 
 
452 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.24 
 
 
445 aa  387  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  48.93 
 
 
442 aa  382  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.35 
 
 
452 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  54.1 
 
 
435 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  53.86 
 
 
435 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  48.02 
 
 
439 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  50.72 
 
 
443 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  47.83 
 
 
449 aa  378  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  47.27 
 
 
441 aa  375  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.35 
 
 
448 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  47.03 
 
 
458 aa  372  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  45.61 
 
 
504 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.91 
 
 
474 aa  371  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.13 
 
 
432 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  52.77 
 
 
445 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  46.78 
 
 
443 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.16 
 
 
454 aa  371  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  50.49 
 
 
441 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  46.92 
 
 
465 aa  369  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  52.51 
 
 
445 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.44 
 
 
449 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  45.65 
 
 
485 aa  371  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  47.38 
 
 
468 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  52.51 
 
 
445 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  49.49 
 
 
443 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.73 
 
 
480 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
452 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.08 
 
 
460 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.58 
 
 
448 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  47.94 
 
 
446 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  47.54 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.61 
 
 
448 aa  365  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.55 
 
 
461 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  47.54 
 
 
451 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.71 
 
 
463 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  49.74 
 
 
443 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  47.34 
 
 
446 aa  365  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.23 
 
 
462 aa  364  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.55 
 
 
461 aa  365  1e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  47.26 
 
 
452 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  43.38 
 
 
450 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
458 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
458 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  47.76 
 
 
475 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  47.2 
 
 
451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  47.38 
 
 
451 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  47.38 
 
 
451 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  45.41 
 
 
472 aa  362  8e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>