More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0526 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
475 aa  956    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  64.9 
 
 
445 aa  581  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  65.48 
 
 
441 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  65.71 
 
 
441 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  65 
 
 
454 aa  553  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  64.52 
 
 
441 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  64.52 
 
 
441 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  65.23 
 
 
441 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  65.87 
 
 
440 aa  545  1e-154  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  60.14 
 
 
445 aa  514  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  63.79 
 
 
450 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  62.17 
 
 
452 aa  508  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  62.17 
 
 
453 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  61.85 
 
 
451 aa  502  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  61.85 
 
 
451 aa  502  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  55.78 
 
 
448 aa  482  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  61.94 
 
 
451 aa  480  1e-134  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  54.97 
 
 
455 aa  458  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.63 
 
 
433 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.87 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.12 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  47.02 
 
 
444 aa  392  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  48.51 
 
 
433 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  47.02 
 
 
437 aa  395  1e-108  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  47.1 
 
 
450 aa  390  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  49.4 
 
 
436 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  50.37 
 
 
422 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
454 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.44 
 
 
448 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 
465 aa  385  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 
437 aa  385  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  49.29 
 
 
441 aa  382  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  48.41 
 
 
441 aa  382  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47 
 
 
435 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.72 
 
 
441 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  48.58 
 
 
443 aa  379  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  50.94 
 
 
436 aa  381  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
489 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  47.96 
 
 
443 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.22 
 
 
474 aa  376  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 
439 aa  376  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  48.81 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  47.8 
 
 
443 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  47.54 
 
 
438 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  49.29 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  46.7 
 
 
463 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  48.72 
 
 
450 aa  375  1e-102  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  47.14 
 
 
443 aa  373  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  45.6 
 
 
437 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  48.58 
 
 
453 aa  371  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  47.9 
 
 
442 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 
432 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.33 
 
 
460 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  47.91 
 
 
441 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  44.52 
 
 
450 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.28 
 
 
438 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  48.02 
 
 
439 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  48.4 
 
 
439 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  45.64 
 
 
472 aa  366  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  45.87 
 
 
446 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  47.52 
 
 
437 aa  365  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  48.1 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.31 
 
 
442 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  47.98 
 
 
449 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  47.04 
 
 
452 aa  365  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  45.95 
 
 
458 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  43.26 
 
 
436 aa  365  1e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  45.95 
 
 
427 aa  365  1e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  47.61 
 
 
434 aa  364  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  47.61 
 
 
434 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  49 
 
 
442 aa  363  4e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  47.63 
 
 
451 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  49.38 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  47.86 
 
 
439 aa  362  8e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  48.2 
 
 
472 aa  362  9e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  46.37 
 
 
436 aa  361  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  47.85 
 
 
435 aa  360  4e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  47.98 
 
 
449 aa  360  4e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  45.86 
 
 
444 aa  359  5e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  45.27 
 
 
449 aa  359  5e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  46.57 
 
 
452 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  46.6 
 
 
436 aa  359  6e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  46.62 
 
 
470 aa  359  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  47.96 
 
 
458 aa  358  8e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  49.5 
 
 
439 aa  358  8e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  47.94 
 
 
446 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  49.53 
 
 
440 aa  358  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  45.92 
 
 
448 aa  358  9e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  47.18 
 
 
448 aa  358  9e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.57 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  45.37 
 
 
442 aa  357  2.9999999999999997e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  48.1 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  45.72 
 
 
434 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.81 
 
 
480 aa  356  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  48.77 
 
 
442 aa  356  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  48.77 
 
 
442 aa  356  5e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  48.14 
 
 
458 aa  355  6.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  44.8 
 
 
449 aa  355  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  45.12 
 
 
485 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
443 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>