More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3246 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 450 aa  891    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  58.68 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  57.7 
 
 		 436 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  57.44 
 
 		 436 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  53.08 
 
 		 442 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  57.24 
 
 		 436 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  50.68 
 
 		 440 aa  421  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  44.52 
 
 		 475 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  48.59 
 
 		 448 aa  355  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  45.87 
 
 		 441 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  45.18 
 
 		 441 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  45.27 
 
 		 441 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  44.34 
 
 		 454 aa  349  5e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  45.54 
 
 		 440 aa  348  9e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  44.6 
 
 		 441 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  45.89 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  43.68 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  46.58 
 
 		 455 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  45.5 
 
 		 453 aa  339  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  45.69 
 
 		 450 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  45.23 
 
 		 452 aa  332  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  44.34 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  44.34 
 
 		 451 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  44.09 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  42.45 
 
 		 436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  41.97 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  44.42 
 
 		 442 aa  310  4e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  44.42 
 
 		 442 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  44.42 
 
 		 442 aa  309  8e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  48.4 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.75 
 
 		 449 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  42.01 
 
 		 454 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.22 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.75 
 
 		 449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  39.63 
 
 		 443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  44.21 
 
 		 443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  43.07 
 
 		 465 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  44.18 
 
 		 441 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  44.56 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  42.57 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  42.29 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  44.76 
 
 		 449 aa  300  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  39.71 
 
 		 431 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  42.32 
 
 		 442 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  39.24 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  42.14 
 
 		 464 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.33 
 
 		 474 aa  296  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  44.56 
 
 		 460 aa  296  4e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  41.93 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 489 aa  296  6e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  45.73 
 
 		 439 aa  295  9e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  39.68 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  39.9 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  41.93 
 
 		 452 aa  294  2e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  39.13 
 
 		 486 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  39.77 
 
 		 442 aa  295  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  41.06 
 
 		 451 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  47.09 
 
 		 460 aa  293  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  39.07 
 
 		 435 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  44.53 
 
 		 465 aa  293  5e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  47.23 
 
 		 441 aa  292  6e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  38.16 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  35.24 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  38.85 
 
 		 472 aa  291  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  39.07 
 
 		 435 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  39.85 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  38.03 
 
 		 464 aa  290  3e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  40.76 
 
 		 448 aa  290  4e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  42.13 
 
 		 452 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  39.76 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  40.84 
 
 		 451 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  40.09 
 
 		 437 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.51 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  42.96 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  39.72 
 
 		 524 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  42.36 
 
 		 461 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  41.19 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  38.72 
 
 		 470 aa  287  2.9999999999999996e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  39.86 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  41.67 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  43.99 
 
 		 480 aa  286  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  39.17 
 
 		 446 aa  286  4e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  39.01 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  39.01 
 
 		 513 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  37.55 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  39.01 
 
 		 514 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  39.42 
 
 		 547 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  42.56 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  41.56 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  41.22 
 
 		 519 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  42.56 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  40.05 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  40.15 
 
 		 454 aa  286  7e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  41.04 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  40.05 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  40.05 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  40.05 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  40.05 
 
 		 456 aa  286  7e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  42.71 
 
 		 465 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  41.01 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>