More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0001 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  98.85 
 
 		 436 aa  825    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 		 436 aa  834    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  86.21 
 
 		 436 aa  698    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  59.77 
 
 		 442 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  62.82 
 
 		 444 aa  509  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  57.24 
 
 		 450 aa  478  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  58.06 
 
 		 440 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  46.6 
 
 		 475 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  47.41 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  48.69 
 
 		 455 aa  345  7e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  44.29 
 
 		 445 aa  343  4e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 		 453 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  47.18 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  47.18 
 
 		 451 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  46.6 
 
 		 452 aa  333  2e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  46.45 
 
 		 450 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  42.3 
 
 		 440 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  42.49 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  43.25 
 
 		 441 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  44.75 
 
 		 441 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  47.06 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  47.06 
 
 		 442 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  46.93 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  41.38 
 
 		 441 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  42.24 
 
 		 441 aa  315  9e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  42.48 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  43.87 
 
 		 445 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  44.68 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  40.19 
 
 		 426 aa  309  8e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  41.98 
 
 		 422 aa  306  3e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  44.64 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  44.72 
 
 		 436 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  46.75 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  43.39 
 
 		 466 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  44.71 
 
 		 451 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  46.27 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  43.1 
 
 		 465 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  44.15 
 
 		 465 aa  300  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  39.95 
 
 		 437 aa  299  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  41.38 
 
 		 433 aa  299  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  40.54 
 
 		 431 aa  299  8e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.93 
 
 		 474 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  44.98 
 
 		 439 aa  295  7e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  38.94 
 
 		 436 aa  295  2e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  45 
 
 		 450 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  45.28 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  41.3 
 
 		 456 aa  293  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  44.12 
 
 		 489 aa  291  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  39.36 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  42.11 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  41.53 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  41.53 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  41.53 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  41.53 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  41.53 
 
 		 456 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  41.51 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  46.95 
 
 		 435 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  40.42 
 
 		 454 aa  289  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.12 
 
 		 439 aa  289  8e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  42.86 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  42.86 
 
 		 458 aa  288  1e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  39.04 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  39.57 
 
 		 447 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  44.58 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.24 
 
 		 435 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  46.77 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  41.69 
 
 		 442 aa  288  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  38.66 
 
 		 472 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  39.68 
 
 		 456 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  41.65 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  39.68 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  44.8 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  42.59 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  40.69 
 
 		 437 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  39.14 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  43.85 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  47.83 
 
 		 460 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  44.17 
 
 		 462 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  39.53 
 
 		 445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  41.6 
 
 		 439 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.6 
 
 		 439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  40.98 
 
 		 452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  43.32 
 
 		 467 aa  283  6.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  43.87 
 
 		 446 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  40.53 
 
 		 443 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  39.81 
 
 		 442 aa  282  8.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  40.85 
 
 		 537 aa  282  8.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  41.67 
 
 		 443 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  44.17 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  44.17 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  41.97 
 
 		 435 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  41.22 
 
 		 461 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.92 
 
 		 458 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  46.27 
 
 		 488 aa  281  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  40.14 
 
 		 443 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  45.81 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  38.57 
 
 		 437 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  38.7 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  43.87 
 
 		 446 aa  281  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  44.71 
 
 		 486 aa  281  2e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>