More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2109 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 		 444 aa  869    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  64.35 
 
 		 436 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  63.28 
 
 		 436 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  62.82 
 
 		 436 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  58.88 
 
 		 442 aa  496  1e-139  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  58.68 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  56.1 
 
 		 440 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  47.02 
 
 		 475 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  45.93 
 
 		 445 aa  397  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  48.07 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  46.12 
 
 		 441 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  46.48 
 
 		 441 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  46.38 
 
 		 441 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  45.41 
 
 		 440 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  45.77 
 
 		 441 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  48.02 
 
 		 450 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  45.65 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  45.68 
 
 		 445 aa  363  3e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  45.89 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  48.88 
 
 		 453 aa  352  1e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  46.53 
 
 		 452 aa  349  5e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  48.17 
 
 		 451 aa  349  5e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  48.17 
 
 		 451 aa  348  7e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  47.22 
 
 		 451 aa  333  5e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  43.64 
 
 		 426 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  45.45 
 
 		 464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  44.05 
 
 		 422 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  46.46 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  39.81 
 
 		 437 aa  323  5e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  43.81 
 
 		 465 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  43.56 
 
 		 466 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  41.46 
 
 		 437 aa  318  1e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  44.44 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  43.22 
 
 		 441 aa  316  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  46.73 
 
 		 465 aa  315  8e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  42.14 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  44.68 
 
 		 450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  43.38 
 
 		 442 aa  313  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  42.93 
 
 		 489 aa  312  7.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  40.7 
 
 		 433 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  43.72 
 
 		 443 aa  309  5e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  42.35 
 
 		 436 aa  309  5.9999999999999995e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.19 
 
 		 439 aa  308  9e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  42.12 
 
 		 458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  44.81 
 
 		 435 aa  305  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  44.23 
 
 		 467 aa  305  9.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  46.15 
 
 		 453 aa  305  1.0000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  37.86 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  40.33 
 
 		 454 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  43.94 
 
 		 442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.04 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  42.56 
 
 		 439 aa  305  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  42.72 
 
 		 441 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.78 
 
 		 474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  45.16 
 
 		 446 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  47.52 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  40.38 
 
 		 439 aa  305  2.0000000000000002e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  42.18 
 
 		 454 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  44.95 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  42.82 
 
 		 442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  41.15 
 
 		 464 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  41.53 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  40.62 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  47.55 
 
 		 434 aa  302  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  40.25 
 
 		 436 aa  301  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  46.72 
 
 		 435 aa  301  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  42.33 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  42.59 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  43.4 
 
 		 431 aa  300  3e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  41.91 
 
 		 442 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  40.79 
 
 		 449 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  42.42 
 
 		 519 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  39.3 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  44.21 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  39.3 
 
 		 456 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  40.98 
 
 		 547 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  39.86 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  41.65 
 
 		 486 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  41.79 
 
 		 537 aa  297  2e-79  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  40.7 
 
 		 449 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  39.66 
 
 		 435 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  41.56 
 
 		 471 aa  297  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  39.07 
 
 		 485 aa  297  3e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 514 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  43.38 
 
 		 487 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  41.49 
 
 		 552 aa  296  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  41.72 
 
 		 513 aa  296  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  40.28 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  42.75 
 
 		 443 aa  296  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  42.24 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  41.26 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  41.49 
 
 		 524 aa  295  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  40.91 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  40.37 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  39.29 
 
 		 456 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  46.79 
 
 		 439 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>