More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3098 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
443 aa  884    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  58.8 
 
 
436 aa  474  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  56.81 
 
 
454 aa  463  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  56.81 
 
 
442 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  55.92 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  57.35 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.04 
 
 
489 aa  454  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  57.7 
 
 
436 aa  453  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  56.07 
 
 
426 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  55.12 
 
 
437 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  56.14 
 
 
441 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  53.25 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  53.81 
 
 
437 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  54.73 
 
 
437 aa  444  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  54.13 
 
 
438 aa  442  1e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.88 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  54.61 
 
 
431 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  54.68 
 
 
422 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  53.29 
 
 
443 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.9 
 
 
433 aa  435  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  52.11 
 
 
434 aa  435  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  52.74 
 
 
434 aa  436  1e-121  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  53.75 
 
 
434 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 
434 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  54.55 
 
 
441 aa  430  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  52.98 
 
 
442 aa  429  1e-119  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  49.89 
 
 
504 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.18 
 
 
441 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  50.61 
 
 
442 aa  421  1e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.35 
 
 
435 aa  421  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.35 
 
 
432 aa  419  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  51.53 
 
 
439 aa  420  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  52.8 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  52.88 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  54.68 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  54 
 
 
449 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  51.14 
 
 
480 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  52.9 
 
 
440 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  52.07 
 
 
443 aa  415  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.04 
 
 
450 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  55.26 
 
 
437 aa  410  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  50.69 
 
 
443 aa  411  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.67 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  52.18 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  50.12 
 
 
446 aa  403  1e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  52.51 
 
 
448 aa  404  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  54.57 
 
 
439 aa  402  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.12 
 
 
449 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  50.82 
 
 
460 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  51.39 
 
 
552 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  52.77 
 
 
458 aa  398  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  51.73 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  51.39 
 
 
549 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  50.24 
 
 
485 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  50.8 
 
 
468 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  52.81 
 
 
459 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  51.84 
 
 
435 aa  398  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  54.1 
 
 
449 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  52.64 
 
 
446 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
439 aa  397  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  52.17 
 
 
463 aa  397  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  50.23 
 
 
442 aa  393  1e-108  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.63 
 
 
449 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  49.32 
 
 
547 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
456 aa  390  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.95 
 
 
464 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  48.2 
 
 
472 aa  389  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
456 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  50.46 
 
 
446 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
456 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
456 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
456 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  50.47 
 
 
456 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  51.42 
 
 
457 aa  388  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  48.65 
 
 
513 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1701  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
457 aa  388  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0163805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
457 aa  388  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
457 aa  388  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  49.64 
 
 
452 aa  386  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  48.87 
 
 
519 aa  388  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  51.06 
 
 
454 aa  388  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
456 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  49.43 
 
 
472 aa  387  1e-106  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  51.08 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
446 aa  387  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
456 aa  387  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  48.65 
 
 
513 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1243  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
457 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  48.65 
 
 
513 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  48.65 
 
 
514 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  48.65 
 
 
513 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2717  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
457 aa  388  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.437776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  50.49 
 
 
458 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
439 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.09 
 
 
439 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  52.1 
 
 
446 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>