More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3947 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  85.65 
 
 
452 aa  723    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  85.38 
 
 
451 aa  718    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  85.15 
 
 
451 aa  719    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
451 aa  878    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  84.88 
 
 
450 aa  712    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  89.26 
 
 
453 aa  762    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  70.78 
 
 
441 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  70.55 
 
 
441 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  70.23 
 
 
441 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  68.98 
 
 
440 aa  613  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  70 
 
 
441 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  69.46 
 
 
441 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  68.76 
 
 
454 aa  604  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  66.59 
 
 
445 aa  579  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  61.94 
 
 
475 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  59.91 
 
 
445 aa  495  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  61.54 
 
 
448 aa  496  1e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  55.58 
 
 
455 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.15 
 
 
422 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  48.36 
 
 
426 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.43 
 
 
450 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  51.76 
 
 
453 aa  393  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.82 
 
 
433 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  49.77 
 
 
441 aa  391  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  45.75 
 
 
431 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  45.66 
 
 
434 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.29 
 
 
441 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  48.58 
 
 
437 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  46.6 
 
 
439 aa  385  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  55.06 
 
 
436 aa  380  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 
442 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  48.16 
 
 
440 aa  376  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  49.2 
 
 
436 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  46.21 
 
 
437 aa  375  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.34 
 
 
454 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.65 
 
 
474 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  45.14 
 
 
437 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.43 
 
 
459 aa  375  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.84 
 
 
435 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  45.1 
 
 
437 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  45.73 
 
 
443 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  46.28 
 
 
438 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 
489 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.6 
 
 
442 aa  369  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  49.52 
 
 
433 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.14 
 
 
441 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  46.04 
 
 
427 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  51.22 
 
 
442 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  51.22 
 
 
442 aa  365  1e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  47.33 
 
 
443 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.14 
 
 
439 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  49.4 
 
 
441 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  49.08 
 
 
437 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  46.99 
 
 
448 aa  362  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
435 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  46.28 
 
 
434 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  46.28 
 
 
434 aa  360  2e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  47.63 
 
 
449 aa  360  4e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  51.78 
 
 
442 aa  359  6e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.58 
 
 
443 aa  359  6e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  48.02 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  47.15 
 
 
468 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  51.26 
 
 
439 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  50.23 
 
 
439 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  46.48 
 
 
440 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  45.32 
 
 
464 aa  353  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  50.38 
 
 
441 aa  353  4e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50.26 
 
 
458 aa  353  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  46.3 
 
 
432 aa  352  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  46.15 
 
 
443 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  42.73 
 
 
442 aa  350  2e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  48.24 
 
 
446 aa  351  2e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  49.34 
 
 
443 aa  350  3e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  43.97 
 
 
504 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  50.23 
 
 
435 aa  349  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  44.31 
 
 
434 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  45.73 
 
 
451 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  46 
 
 
442 aa  348  9e-95  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  46.86 
 
 
440 aa  348  9e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  46.05 
 
 
442 aa  348  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  43.85 
 
 
443 aa  347  3e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  46.14 
 
 
465 aa  347  3e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  45.27 
 
 
451 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  47.1 
 
 
446 aa  346  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  45.15 
 
 
463 aa  346  5e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.52 
 
 
460 aa  346  6e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  45.48 
 
 
480 aa  345  8e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  45.58 
 
 
448 aa  345  8.999999999999999e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  45.7 
 
 
438 aa  345  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  49.09 
 
 
435 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  45.58 
 
 
452 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  49.77 
 
 
435 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.58 
 
 
452 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  48.71 
 
 
446 aa  342  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  45.56 
 
 
452 aa  342  7e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  44.47 
 
 
452 aa  342  7e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  44.27 
 
 
456 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  44.02 
 
 
436 aa  342  1e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  46.45 
 
 
442 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  44.27 
 
 
456 aa  340  2e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>