More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1269 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  79.81 
 
 
443 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
434 aa  868    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  70.93 
 
 
438 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  70.64 
 
 
427 aa  616  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  64.49 
 
 
442 aa  552  1e-156  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  58.69 
 
 
439 aa  527  1e-148  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  58.88 
 
 
431 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  62.15 
 
 
437 aa  523  1e-147  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  59.2 
 
 
436 aa  521  1e-147  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  59.52 
 
 
433 aa  522  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  60.77 
 
 
437 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  60.24 
 
 
437 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  59 
 
 
437 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  60.24 
 
 
434 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  56.71 
 
 
436 aa  498  1e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  56.54 
 
 
441 aa  497  1e-139  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  57.52 
 
 
426 aa  483  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  55.16 
 
 
422 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  56.06 
 
 
442 aa  481  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  57.32 
 
 
441 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  56.26 
 
 
442 aa  477  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  52.52 
 
 
454 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  54.29 
 
 
433 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  54.44 
 
 
434 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  56.12 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  54.83 
 
 
434 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  53.24 
 
 
441 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  56.53 
 
 
450 aa  455  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  53 
 
 
449 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  53.17 
 
 
435 aa  448  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  53 
 
 
441 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.35 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  53.13 
 
 
443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  53.66 
 
 
438 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  50.92 
 
 
489 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  53.27 
 
 
439 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  53.59 
 
 
432 aa  442  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  52.64 
 
 
440 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  53.28 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  53.17 
 
 
438 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.74 
 
 
443 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  51.31 
 
 
434 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49.89 
 
 
468 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  52.26 
 
 
448 aa  432  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  51.65 
 
 
437 aa  434  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  47.11 
 
 
504 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  52.9 
 
 
453 aa  430  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  51.21 
 
 
440 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  48.83 
 
 
440 aa  431  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  50.84 
 
 
439 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  48.87 
 
 
445 aa  426  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  49.66 
 
 
443 aa  427  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  49.41 
 
 
446 aa  427  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  48.17 
 
 
446 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
444 aa  425  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  50.72 
 
 
440 aa  428  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  48.87 
 
 
485 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  47.95 
 
 
446 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  49.04 
 
 
441 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  49.09 
 
 
446 aa  423  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.94 
 
 
458 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  49.31 
 
 
445 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  49.31 
 
 
445 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.19 
 
 
445 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.7 
 
 
458 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  49.08 
 
 
445 aa  424  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  48.19 
 
 
445 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  47.85 
 
 
446 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  48.19 
 
 
445 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  48.19 
 
 
445 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.5 
 
 
459 aa  419  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
462 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.7 
 
 
461 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  50.47 
 
 
458 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
458 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  50.72 
 
 
446 aa  419  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.7 
 
 
461 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
435 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  48.19 
 
 
445 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  49.42 
 
 
463 aa  418  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  49.66 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  48.8 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  47.61 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  49.54 
 
 
452 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  47.36 
 
 
458 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.39 
 
 
439 aa  415  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  48.09 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  48.74 
 
 
446 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  49.53 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  47.13 
 
 
444 aa  414  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.87 
 
 
452 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  49.64 
 
 
439 aa  415  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  50.24 
 
 
439 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  49.09 
 
 
452 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  49.05 
 
 
465 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  49.09 
 
 
451 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  48.24 
 
 
442 aa  412  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  49.64 
 
 
442 aa  413  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.73 
 
 
460 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  48.19 
 
 
459 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>