More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_42570 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  83.41 
 
 
439 aa  721    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  80 
 
 
440 aa  701    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  100 
 
 
440 aa  884    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  80.24 
 
 
440 aa  699    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  67.22 
 
 
438 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  66.12 
 
 
438 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  60.63 
 
 
442 aa  488  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  60.9 
 
 
439 aa  481  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  57.76 
 
 
458 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  57.76 
 
 
461 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  57.76 
 
 
461 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  57.76 
 
 
458 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  56.25 
 
 
462 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  57.52 
 
 
458 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  56.12 
 
 
442 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  53.59 
 
 
437 aa  464  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  55.02 
 
 
441 aa  462  1e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  53.35 
 
 
437 aa  461  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  57.07 
 
 
429 aa  463  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  56.59 
 
 
442 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  52.9 
 
 
437 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  55.25 
 
 
436 aa  457  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  52.19 
 
 
431 aa  455  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  56.32 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.15 
 
 
433 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.12 
 
 
427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  52.4 
 
 
438 aa  448  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  52.33 
 
 
437 aa  451  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.05 
 
 
439 aa  444  1e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  55.12 
 
 
435 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  54.04 
 
 
454 aa  442  1e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  55.12 
 
 
434 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.17 
 
 
441 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  56.65 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  58.87 
 
 
449 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  56.65 
 
 
445 aa  438  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  53.76 
 
 
433 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  56.9 
 
 
445 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  58.87 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  50.23 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  53.21 
 
 
442 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  58.87 
 
 
449 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.7 
 
 
432 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  51.61 
 
 
442 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  52.24 
 
 
443 aa  437  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  56.9 
 
 
463 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  55.26 
 
 
443 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  52.78 
 
 
434 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  51.87 
 
 
441 aa  435  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  56.29 
 
 
442 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  56.28 
 
 
442 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  56.9 
 
 
463 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  56.28 
 
 
442 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  56.29 
 
 
442 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  56.29 
 
 
429 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  56.29 
 
 
442 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  54.52 
 
 
443 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  51.53 
 
 
443 aa  431  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  48.83 
 
 
434 aa  431  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  54.19 
 
 
435 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  56.29 
 
 
442 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  49.3 
 
 
443 aa  426  1e-118  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  55.29 
 
 
436 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  53.72 
 
 
435 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  49.16 
 
 
442 aa  426  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  55.22 
 
 
433 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  55.11 
 
 
433 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  55.22 
 
 
433 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  55.22 
 
 
433 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  55.22 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  53.61 
 
 
441 aa  415  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  48.57 
 
 
435 aa  410  1e-113  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  52.29 
 
 
489 aa  411  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.88 
 
 
446 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.61 
 
 
426 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  50.6 
 
 
422 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
441 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.29 
 
 
450 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  51.6 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  53.79 
 
 
449 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  50.48 
 
 
449 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  50.68 
 
 
439 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.92 
 
 
474 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  53.55 
 
 
449 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  51.63 
 
 
439 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 
435 aa  393  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  48.17 
 
 
453 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3118  ATPase FliI/YscN  50.96 
 
 
444 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00379895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.02 
 
 
463 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  47.87 
 
 
437 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  46.26 
 
 
485 aa  383  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  52.07 
 
 
452 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  49.3 
 
 
442 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.32 
 
 
459 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.65 
 
 
459 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.56 
 
 
443 aa  381  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.95 
 
 
460 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.01 
 
 
448 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>