More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4210 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  83.22 
 
 
441 aa  749    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
443 aa  892    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  84.76 
 
 
434 aa  757    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  83.75 
 
 
443 aa  756    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  80.09 
 
 
439 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  79.86 
 
 
432 aa  699    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  84.76 
 
 
434 aa  758    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  66.36 
 
 
433 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  62.47 
 
 
437 aa  532  1e-150  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  58.76 
 
 
437 aa  511  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  58.93 
 
 
435 aa  514  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  58.84 
 
 
442 aa  512  1e-144  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  58.2 
 
 
437 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  59.03 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  60.05 
 
 
441 aa  502  1e-141  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  59.27 
 
 
436 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  57.81 
 
 
433 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  55.35 
 
 
439 aa  486  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  57.37 
 
 
434 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  57.45 
 
 
454 aa  483  1e-135  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  55.84 
 
 
442 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  56.41 
 
 
431 aa  474  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  57.85 
 
 
440 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  57 
 
 
449 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  56.12 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  52.79 
 
 
442 aa  460  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  56.4 
 
 
443 aa  458  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  58.01 
 
 
436 aa  457  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  53.33 
 
 
438 aa  458  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  55.65 
 
 
468 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.57 
 
 
427 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  53.53 
 
 
441 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  59.16 
 
 
437 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  52.17 
 
 
504 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  56.02 
 
 
448 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  54.52 
 
 
426 aa  442  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  56.53 
 
 
489 aa  444  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  56.39 
 
 
422 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  52.97 
 
 
440 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  52.49 
 
 
440 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  52.24 
 
 
440 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  55.43 
 
 
450 aa  429  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  52.72 
 
 
439 aa  431  1e-119  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  52.52 
 
 
442 aa  426  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.09 
 
 
439 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.4 
 
 
474 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.57 
 
 
458 aa  424  1e-117  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.87 
 
 
480 aa  418  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  49.78 
 
 
472 aa  416  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  51.04 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  49.55 
 
 
487 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  49.78 
 
 
466 aa  415  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.9 
 
 
438 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.07 
 
 
443 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  49.16 
 
 
446 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  51.21 
 
 
463 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  50.24 
 
 
453 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  51.42 
 
 
441 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  47.97 
 
 
465 aa  408  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  49.44 
 
 
471 aa  410  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.35 
 
 
442 aa  410  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.84 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  48.54 
 
 
464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  48.92 
 
 
435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  52.42 
 
 
446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  51.97 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.45 
 
 
451 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  49.76 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  50.84 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  50.35 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  49.88 
 
 
485 aa  402  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.96 
 
 
449 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  49.1 
 
 
468 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  48.97 
 
 
452 aa  402  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  48.5 
 
 
460 aa  403  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  44.47 
 
 
450 aa  402  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.16 
 
 
445 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  49.18 
 
 
437 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
439 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  51.79 
 
 
445 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  51.79 
 
 
445 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  46.67 
 
 
443 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  51.79 
 
 
445 aa  403  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  51.67 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.24 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  47.67 
 
 
451 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.1 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  50.24 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  47.48 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  52.9 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  47.88 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.91 
 
 
448 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  48.11 
 
 
435 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.66 
 
 
435 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  53.61 
 
 
460 aa  398  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>