More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2405 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
442 aa  893    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  66.97 
 
 
441 aa  590  1e-167  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  66.2 
 
 
436 aa  583  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  62.87 
 
 
454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  63.15 
 
 
437 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  62.36 
 
 
436 aa  540  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  59.35 
 
 
437 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  60.46 
 
 
437 aa  521  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  61.32 
 
 
437 aa  521  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  60.14 
 
 
441 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  61.68 
 
 
433 aa  509  1e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  59.26 
 
 
442 aa  507  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  58.31 
 
 
431 aa  504  1e-141  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  62.11 
 
 
422 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  60.14 
 
 
426 aa  499  1e-140  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  57.37 
 
 
439 aa  497  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  58.35 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  61.26 
 
 
489 aa  493  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  57.87 
 
 
438 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  57.34 
 
 
434 aa  489  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  59.09 
 
 
433 aa  488  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  56.71 
 
 
434 aa  488  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  59.47 
 
 
450 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  56.42 
 
 
443 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  55.84 
 
 
443 aa  476  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  56.26 
 
 
434 aa  477  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  57.11 
 
 
434 aa  474  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  57.59 
 
 
449 aa  472  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  56.88 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.48 
 
 
441 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  56.02 
 
 
443 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  56.37 
 
 
432 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  54.63 
 
 
474 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  56.81 
 
 
443 aa  462  1e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  54.68 
 
 
435 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  56.28 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  55.69 
 
 
441 aa  455  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  54.99 
 
 
434 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  56.57 
 
 
441 aa  450  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  53.65 
 
 
440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  59.4 
 
 
437 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  55.04 
 
 
440 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  53.25 
 
 
442 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  55.13 
 
 
442 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  54.42 
 
 
468 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  53.21 
 
 
439 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  53.21 
 
 
440 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  55.53 
 
 
448 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  52.47 
 
 
440 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  54.24 
 
 
458 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  53.3 
 
 
504 aa  434  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  54.24 
 
 
461 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  54.24 
 
 
458 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  53.86 
 
 
442 aa  429  1e-119  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  52.98 
 
 
435 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.51 
 
 
462 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  54 
 
 
458 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  53.38 
 
 
438 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  54.24 
 
 
461 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  53.9 
 
 
438 aa  428  1e-118  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  55.18 
 
 
435 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  52.98 
 
 
435 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 
442 aa  421  1e-117  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.55 
 
 
459 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  51.99 
 
 
460 aa  421  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  50.57 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  51.67 
 
 
446 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  52.29 
 
 
439 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  51.29 
 
 
445 aa  412  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  54.57 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  54.94 
 
 
442 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  54.57 
 
 
429 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  51.04 
 
 
445 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  50.12 
 
 
480 aa  415  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  54.57 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  52.94 
 
 
446 aa  413  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  51.64 
 
 
446 aa  412  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
446 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  54.57 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  51.5 
 
 
435 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  54.57 
 
 
442 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  50.61 
 
 
439 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  48.47 
 
 
472 aa  411  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  54.7 
 
 
442 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  52.63 
 
 
435 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  50.69 
 
 
446 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  51.29 
 
 
445 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  51.29 
 
 
445 aa  410  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.51 
 
 
439 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  53.48 
 
 
439 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  51.05 
 
 
445 aa  409  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  51.91 
 
 
439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  48.59 
 
 
481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  48.35 
 
 
471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  52.78 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  51.49 
 
 
472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>