More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0975 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
435 aa  847    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  64.64 
 
 
439 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  64.3 
 
 
439 aa  502  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  62.92 
 
 
446 aa  500  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  61.59 
 
 
453 aa  496  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  61.65 
 
 
459 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  60.94 
 
 
435 aa  485  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  60.89 
 
 
446 aa  484  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  55.89 
 
 
437 aa  437  1e-121  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  55.8 
 
 
436 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  50.82 
 
 
437 aa  432  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  54.61 
 
 
436 aa  432  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  55.89 
 
 
433 aa  430  1e-119  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  51.4 
 
 
443 aa  429  1e-119  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.76 
 
 
489 aa  427  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  51.32 
 
 
431 aa  422  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.11 
 
 
437 aa  420  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.2 
 
 
439 aa  419  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
434 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  50.36 
 
 
437 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  52.5 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  52.5 
 
 
438 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  54.98 
 
 
436 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.48 
 
 
426 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.77 
 
 
422 aa  414  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  53.6 
 
 
441 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  52.63 
 
 
442 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  50.34 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  51.22 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  51.43 
 
 
441 aa  402  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  52 
 
 
437 aa  402  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  53.77 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  48.31 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.69 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  52.38 
 
 
446 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
441 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  51.03 
 
 
446 aa  398  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  54.29 
 
 
468 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  51.43 
 
 
446 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  51.84 
 
 
443 aa  398  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  49.88 
 
 
440 aa  393  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  50.95 
 
 
446 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  49.64 
 
 
447 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  51.44 
 
 
446 aa  393  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  52.11 
 
 
440 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  50.72 
 
 
446 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  50.6 
 
 
446 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
439 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  48.64 
 
 
504 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.4 
 
 
450 aa  390  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  51.86 
 
 
440 aa  388  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  50.24 
 
 
445 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  52.88 
 
 
441 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.36 
 
 
433 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.48 
 
 
438 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.97 
 
 
434 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  51.77 
 
 
450 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  47.9 
 
 
443 aa  382  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
445 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  56.85 
 
 
435 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  50.36 
 
 
434 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  49.41 
 
 
441 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.82 
 
 
454 aa  382  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
458 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  49.19 
 
 
439 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 
454 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  49.76 
 
 
438 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  49.77 
 
 
478 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.1 
 
 
474 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.17 
 
 
439 aa  378  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
452 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  50.35 
 
 
460 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  48.7 
 
 
439 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.8 
 
 
448 aa  378  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  48.1 
 
 
441 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  48.24 
 
 
439 aa  376  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.58 
 
 
452 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.24 
 
 
449 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.84 
 
 
462 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  48.81 
 
 
440 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  48.1 
 
 
441 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  47.59 
 
 
466 aa  373  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  48 
 
 
465 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  48.26 
 
 
456 aa  373  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
451 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.86 
 
 
463 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  50 
 
 
449 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  48.82 
 
 
439 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  49.18 
 
 
456 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  56.85 
 
 
435 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  49.18 
 
 
456 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  47.76 
 
 
456 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>