More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03396 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  100 
 
 
442 aa  874    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  71.5 
 
 
439 aa  605  9.999999999999999e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  71.69 
 
 
463 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  71.93 
 
 
463 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  69.86 
 
 
449 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  67.52 
 
 
442 aa  592  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  70.9 
 
 
449 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  70.9 
 
 
443 aa  590  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  70.67 
 
 
449 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
429 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  72.2 
 
 
442 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  71.95 
 
 
442 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  60.91 
 
 
462 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  60.67 
 
 
458 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  60.63 
 
 
440 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  60.43 
 
 
461 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  59.9 
 
 
439 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  60.19 
 
 
458 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  60.43 
 
 
461 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  60.43 
 
 
458 aa  488  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  60 
 
 
440 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  59.28 
 
 
438 aa  478  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  59.04 
 
 
440 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  58.55 
 
 
438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  50.8 
 
 
437 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  53.24 
 
 
437 aa  444  1e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  50.8 
 
 
434 aa  442  1e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  53.38 
 
 
442 aa  436  1e-121  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  52.31 
 
 
437 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  53.86 
 
 
442 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  52.12 
 
 
441 aa  431  1e-119  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.35 
 
 
431 aa  426  1e-118  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  52.45 
 
 
436 aa  426  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  51.95 
 
 
437 aa  423  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  48.71 
 
 
438 aa  418  1e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  52.8 
 
 
433 aa  419  1e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
427 aa  421  1e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  50.36 
 
 
443 aa  419  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.66 
 
 
433 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.67 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.3 
 
 
422 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.7 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  52.05 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  48.24 
 
 
434 aa  412  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.4 
 
 
439 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  55.23 
 
 
435 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  51.79 
 
 
454 aa  408  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  52.35 
 
 
436 aa  408  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  52.14 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  52.04 
 
 
449 aa  405  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  51.48 
 
 
445 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  50.85 
 
 
442 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  51.25 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  51.25 
 
 
445 aa  398  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.62 
 
 
434 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.25 
 
 
435 aa  398  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.31 
 
 
474 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
443 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  49.04 
 
 
434 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  54.01 
 
 
435 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
432 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  49.04 
 
 
434 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  53.28 
 
 
435 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  50.6 
 
 
450 aa  388  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  46.73 
 
 
442 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
433 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
433 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
443 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
433 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  52.32 
 
 
443 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  48.2 
 
 
451 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  48.97 
 
 
441 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  50.24 
 
 
445 aa  385  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
433 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.07 
 
 
458 aa  385  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.73 
 
 
439 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  52.08 
 
 
443 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.72 
 
 
485 aa  382  1e-105  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.21 
 
 
441 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  47.84 
 
 
443 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.44 
 
 
448 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  47.72 
 
 
451 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.94 
 
 
448 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
445 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
445 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
445 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  50 
 
 
480 aa  380  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.73 
 
 
443 aa  381  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
445 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  49.51 
 
 
446 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
445 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
445 aa  382  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.96 
 
 
446 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
445 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
445 aa  381  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  48.67 
 
 
463 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>