More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0870 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  100 
 
 		 439 aa  876    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  71.5 
 
 		 442 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  68.67 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  66.82 
 
 		 449 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  66.98 
 
 		 442 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  66.74 
 
 		 442 aa  551  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  68.29 
 
 		 463 aa  552  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  68.26 
 
 		 429 aa  549  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  66.9 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  66.43 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  66.9 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  68.06 
 
 		 463 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  66.9 
 
 		 442 aa  551  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  65.27 
 
 		 449 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  65.27 
 
 		 443 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  65.27 
 
 		 449 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  58.02 
 
 		 440 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  58.53 
 
 		 440 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  60.9 
 
 		 440 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  58.37 
 
 		 439 aa  480  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  56.67 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  55.95 
 
 		 438 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  58.9 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  59.15 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.15 
 
 		 458 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  58.4 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  58.4 
 
 		 461 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  58.4 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 		 437 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  51.39 
 
 		 437 aa  433  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  51.38 
 
 		 442 aa  422  1e-117  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  51.62 
 
 		 441 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.21 
 
 		 427 aa  423  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.97 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.77 
 
 		 439 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  48.8 
 
 		 434 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  53.53 
 
 		 436 aa  417  9.999999999999999e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  51.08 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 		 438 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 		 426 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.82 
 
 		 422 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  50.61 
 
 		 442 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  49.05 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 		 434 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.79 
 
 		 434 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  48.03 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  49.18 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  52.8 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.76 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  48.92 
 
 		 434 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  48.92 
 
 		 434 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  50.24 
 
 		 429 aa  396  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  51.31 
 
 		 436 aa  397  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  49.88 
 
 		 441 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50 
 
 		 433 aa  395  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 		 443 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  48.71 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  53.62 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  47.16 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  49.15 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.1 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.12 
 
 		 450 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  49.64 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  50.25 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 		 454 aa  386  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  51.96 
 
 		 445 aa  383  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  49.62 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  53.62 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  53.38 
 
 		 435 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  52.21 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3118  ATPase FliI/YscN  52.36 
 
 		 444 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  49.19 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  51.96 
 
 		 445 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  48.26 
 
 		 441 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  46.19 
 
 		 435 aa  380  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  46.87 
 
 		 489 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  51.68 
 
 		 449 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  51.44 
 
 		 449 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  46.14 
 
 		 485 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  46.1 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  46.1 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  46.1 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  46.1 
 
 		 445 aa  372  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.12 
 
 		 445 aa  370  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 		 433 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  51.62 
 
 		 452 aa  372  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  45.64 
 
 		 445 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.51 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  46.17 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  46.59 
 
 		 472 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  46.39 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  49.26 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  51.1 
 
 		 442 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  44.39 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  46.39 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  46.33 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  46.41 
 
 		 463 aa  365  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>