More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5851 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  99.35 
 
 		 463 aa  909    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  100 
 
 		 463 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  71.93 
 
 		 442 aa  623  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  74.31 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  74.31 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  74.31 
 
 		 442 aa  618  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  73.85 
 
 		 442 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  73.85 
 
 		 442 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  73.47 
 
 		 442 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  76.44 
 
 		 429 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  72.84 
 
 		 449 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  74.71 
 
 		 449 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  74.71 
 
 		 443 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  74.48 
 
 		 449 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  68.56 
 
 		 442 aa  587  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  68.06 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.52 
 
 		 458 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.52 
 
 		 458 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.04 
 
 		 461 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.04 
 
 		 462 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  59.52 
 
 		 458 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  59.04 
 
 		 461 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  55.96 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  55.68 
 
 		 440 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  55.92 
 
 		 438 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  54.76 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  56.87 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  56.9 
 
 		 440 aa  450  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  49.53 
 
 		 434 aa  414  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  51.6 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  46.87 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  47.59 
 
 		 437 aa  410  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  48.92 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  52.05 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  52.17 
 
 		 436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  48.67 
 
 		 431 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  46.65 
 
 		 443 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  46.44 
 
 		 437 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  52.24 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  46.85 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.33 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  49.62 
 
 		 427 aa  396  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  49.3 
 
 		 442 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  48.57 
 
 		 426 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.61 
 
 		 441 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  49.37 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  49.16 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  50.35 
 
 		 436 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  49.16 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  50.97 
 
 		 422 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  48.69 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  49.77 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  49 
 
 		 445 aa  389  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.72 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  54.66 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  49.76 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  52.44 
 
 		 429 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.75 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  48.06 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  49.77 
 
 		 445 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  49.37 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  52.16 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  47.39 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 		 489 aa  382  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  48.67 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  50.59 
 
 		 435 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  54.91 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.22 
 
 		 442 aa  381  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  49.03 
 
 		 449 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.43 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  54.41 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  47.36 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  50.62 
 
 		 437 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  50.88 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  50.49 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  48.45 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  42.43 
 
 		 442 aa  365  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  50.25 
 
 		 443 aa  364  2e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.77 
 
 		 448 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  47.24 
 
 		 453 aa  363  3e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.89 
 
 		 474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  50.25 
 
 		 455 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  48.86 
 
 		 440 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.58 
 
 		 446 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  46.84 
 
 		 458 aa  359  7e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.04 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  45.83 
 
 		 451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  47.26 
 
 		 481 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  45.59 
 
 		 451 aa  356  5.999999999999999e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  46.45 
 
 		 452 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.19 
 
 		 452 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  47.95 
 
 		 466 aa  354  2e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3118  ATPase FliI/YscN  50.12 
 
 		 444 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  51.11 
 
 		 452 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.78 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  47.02 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  47.02 
 
 		 479 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  50.5 
 
 		 442 aa  353  5e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  47.12 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>