More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1889 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  80.18 
 
 
455 aa  709    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  100 
 
 
459 aa  928    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  65.61 
 
 
452 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  68.38 
 
 
449 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  65.99 
 
 
449 aa  538  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  50.23 
 
 
440 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  51.2 
 
 
440 aa  425  1e-117  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.1 
 
 
458 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  51.3 
 
 
439 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.87 
 
 
461 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  49.32 
 
 
440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.08 
 
 
462 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.87 
 
 
461 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  48.64 
 
 
458 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.87 
 
 
458 aa  405  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  48.2 
 
 
442 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  44.92 
 
 
434 aa  386  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  47.51 
 
 
436 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  47.2 
 
 
427 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  45.64 
 
 
437 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.48 
 
 
438 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  45.16 
 
 
437 aa  385  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  47.37 
 
 
442 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.59 
 
 
446 aa  381  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  46.84 
 
 
438 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  47.76 
 
 
439 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  45.74 
 
 
437 aa  375  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  46.01 
 
 
438 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  47.73 
 
 
449 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  43.41 
 
 
443 aa  376  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  47.26 
 
 
442 aa  375  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  48.97 
 
 
433 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  49.2 
 
 
433 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  43.98 
 
 
437 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  44.63 
 
 
439 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  44.27 
 
 
433 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  48.97 
 
 
433 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  48.97 
 
 
433 aa  372  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  44 
 
 
442 aa  372  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  48.97 
 
 
443 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  46.3 
 
 
441 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  46.45 
 
 
431 aa  364  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  43.76 
 
 
441 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  49.28 
 
 
463 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  49.04 
 
 
463 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.35 
 
 
441 aa  359  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  43.35 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  47.88 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  47.88 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  45.41 
 
 
429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  45.24 
 
 
442 aa  356  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  45.89 
 
 
443 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  45.77 
 
 
443 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  47.88 
 
 
445 aa  355  8.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  44.94 
 
 
434 aa  355  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  48.56 
 
 
443 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  48.56 
 
 
449 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  48.56 
 
 
449 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
429 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  49.4 
 
 
442 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  42.89 
 
 
443 aa  353  4e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  43.14 
 
 
489 aa  353  5e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  49.16 
 
 
442 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  49.16 
 
 
442 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  46.08 
 
 
443 aa  352  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  45.64 
 
 
454 aa  352  1e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  44.6 
 
 
436 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  44.01 
 
 
485 aa  350  4e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.5 
 
 
433 aa  348  9e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  45.18 
 
 
441 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  45.83 
 
 
422 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  44.92 
 
 
439 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  44.62 
 
 
441 aa  347  3e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.27 
 
 
452 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.99 
 
 
442 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  45.05 
 
 
452 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  45.39 
 
 
452 aa  343  4e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  43.23 
 
 
435 aa  342  8e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  43.03 
 
 
434 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  43.03 
 
 
434 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  42.31 
 
 
439 aa  341  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.13 
 
 
448 aa  339  7e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  43.37 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  41.27 
 
 
432 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  45.52 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  45.29 
 
 
451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.76 
 
 
439 aa  336  3.9999999999999995e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  45.27 
 
 
448 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  44.49 
 
 
451 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  44.04 
 
 
451 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.68 
 
 
449 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3379  FliI/YscN family ATPase  43.16 
 
 
445 aa  334  2e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424173  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  44.26 
 
 
443 aa  333  3e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.78 
 
 
449 aa  333  3e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  43.47 
 
 
439 aa  333  3e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  45.3 
 
 
465 aa  333  3e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0253  lateral flagellar export/assembly protein LfiI  42.92 
 
 
445 aa  333  3e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>