More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2822 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  87 
 
 
451 aa  783    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  83.63 
 
 
452 aa  758    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  83.86 
 
 
452 aa  758    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  84.3 
 
 
452 aa  766    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  87 
 
 
451 aa  785    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  87.22 
 
 
452 aa  785    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
448 aa  889    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  89.01 
 
 
451 aa  798    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  88.79 
 
 
451 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  86.77 
 
 
451 aa  781    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  69.93 
 
 
463 aa  598  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  65.67 
 
 
443 aa  568  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  63.78 
 
 
458 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  65.57 
 
 
446 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  62.25 
 
 
470 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  63.22 
 
 
446 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  63.22 
 
 
445 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  65.32 
 
 
458 aa  532  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  63.76 
 
 
446 aa  533  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  62.44 
 
 
445 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  60.82 
 
 
480 aa  531  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  63.43 
 
 
445 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  65.23 
 
 
446 aa  529  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  63.43 
 
 
445 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  64.85 
 
 
445 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  64.85 
 
 
445 aa  529  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  63.66 
 
 
445 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  64.61 
 
 
445 aa  528  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  63.43 
 
 
445 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  63.7 
 
 
549 aa  526  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  62.33 
 
 
488 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  63.08 
 
 
547 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  62.16 
 
 
446 aa  525  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  64.52 
 
 
446 aa  526  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  63.7 
 
 
552 aa  527  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  63.68 
 
 
486 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  65.37 
 
 
446 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  62.79 
 
 
446 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  61.63 
 
 
464 aa  522  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  61.87 
 
 
519 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  62.84 
 
 
524 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  61.87 
 
 
513 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  61.87 
 
 
513 aa  524  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  61.87 
 
 
514 aa  525  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  61.83 
 
 
526 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  61.93 
 
 
513 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.06 
 
 
509 aa  520  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  61.7 
 
 
444 aa  520  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  61.93 
 
 
513 aa  519  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.83 
 
 
523 aa  520  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  60.9 
 
 
472 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  59.64 
 
 
439 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  61.7 
 
 
478 aa  514  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  62.87 
 
 
481 aa  512  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  58.96 
 
 
439 aa  514  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  62.19 
 
 
479 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
439 aa  513  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1958  ATPase FliI/YscN  62.91 
 
 
468 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191624  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  62.19 
 
 
479 aa  511  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  63.57 
 
 
460 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  61.54 
 
 
459 aa  509  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  62.93 
 
 
449 aa  504  9.999999999999999e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  57.95 
 
 
439 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  59.07 
 
 
447 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  62.22 
 
 
449 aa  501  1e-140  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  60 
 
 
456 aa  499  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  60.18 
 
 
465 aa  500  1e-140  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  57.59 
 
 
449 aa  495  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  59 
 
 
444 aa  498  1e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  59.87 
 
 
464 aa  495  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  60.61 
 
 
454 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  59.76 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  59.43 
 
 
456 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  59.76 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  59.76 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  59.76 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  58.65 
 
 
458 aa  492  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  57.67 
 
 
445 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  59.76 
 
 
456 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  59.43 
 
 
456 aa  492  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  60 
 
 
487 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  58.63 
 
 
466 aa  488  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  58.9 
 
 
468 aa  489  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  57.3 
 
 
472 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  57.18 
 
 
449 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2293  flagellum-specific ATP synthase  57.3 
 
 
472 aa  487  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.673762  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  57.52 
 
 
484 aa  486  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  59.13 
 
 
470 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  57.89 
 
 
472 aa  483  1e-135  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  60.36 
 
 
449 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  60.66 
 
 
457 aa  480  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  60.66 
 
 
457 aa  480  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  60.24 
 
 
457 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  57.37 
 
 
471 aa  480  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2717  flagellum-specific ATP synthase  60.66 
 
 
457 aa  480  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.437776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>