More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1400 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  100 
 
 		 449 aa  894    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  95.32 
 
 		 449 aa  826    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  84.51 
 
 		 452 aa  732    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  68.38 
 
 		 459 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  66.06 
 
 		 455 aa  542  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  52.31 
 
 		 440 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  52.69 
 
 		 440 aa  437  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  53.55 
 
 		 440 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  51.42 
 
 		 439 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  52.11 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  50.59 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  51.68 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 438 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  49.77 
 
 		 449 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  45.31 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.41 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  45.31 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.82 
 
 		 438 aa  384  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  50.71 
 
 		 442 aa  383  1e-105  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.61 
 
 		 462 aa  382  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  51.9 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  52.13 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.38 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  51.9 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  51.68 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  48.18 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  52.13 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.38 
 
 		 461 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.41 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  52.13 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  52.66 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  46.74 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  48.73 
 
 		 436 aa  376  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  45.96 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  50.59 
 
 		 443 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 449 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  44.91 
 
 		 431 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  42.86 
 
 		 434 aa  367  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  51.23 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 449 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  51.23 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  44.37 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  51.23 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  49.63 
 
 		 445 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  50.88 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  51.23 
 
 		 433 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  49.38 
 
 		 445 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  49.38 
 
 		 445 aa  362  9e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  42.49 
 
 		 443 aa  362  1e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  44.7 
 
 		 442 aa  361  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  43.68 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  42.83 
 
 		 437 aa  358  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  41.96 
 
 		 442 aa  358  9.999999999999999e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  46.4 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  46.08 
 
 		 422 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  45.01 
 
 		 441 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  47.84 
 
 		 443 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  44.18 
 
 		 439 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  51.11 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  46.45 
 
 		 441 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  50.86 
 
 		 463 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  43.54 
 
 		 437 aa  353  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  45.13 
 
 		 443 aa  352  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  47.36 
 
 		 443 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.43 
 
 		 441 aa  351  1e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  43.87 
 
 		 437 aa  351  2e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.79 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  44.31 
 
 		 434 aa  350  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  44.57 
 
 		 463 aa  348  8e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.06 
 
 		 442 aa  348  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  45.28 
 
 		 449 aa  348  1e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  48.05 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  44.08 
 
 		 434 aa  347  2e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  45.95 
 
 		 446 aa  346  5e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  44.7 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  43.42 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  43.87 
 
 		 432 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.31 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3379  FliI/YscN family ATPase  45.28 
 
 		 445 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  44.79 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  46.93 
 
 		 446 aa  344  2e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0253  lateral flagellar export/assembly protein LfiI  45.04 
 
 		 445 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  44.68 
 
 		 435 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  47.75 
 
 		 446 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.39 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  48.4 
 
 		 445 aa  343  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.94 
 
 		 474 aa  342  5.999999999999999e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  48.4 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  48.4 
 
 		 445 aa  342  7e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  42.76 
 
 		 426 aa  342  8e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  46.81 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  46.06 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  44.86 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  41.1 
 
 		 485 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  45.52 
 
 		 445 aa  341  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  46.21 
 
 		 435 aa  340  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  47.16 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  47.16 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  47.16 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>