More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4744 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  98.64 
 
 		 458 aa  858    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  100 
 
 		 461 aa  910    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  97.72 
 
 		 462 aa  847    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  98.19 
 
 		 458 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  99.13 
 
 		 461 aa  901    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  98.42 
 
 		 458 aa  856    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  58.47 
 
 		 440 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  60.43 
 
 		 442 aa  486  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  58.13 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  59.81 
 
 		 449 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  57.76 
 
 		 440 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  58.75 
 
 		 438 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  56.8 
 
 		 439 aa  472  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  58.41 
 
 		 438 aa  472  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  59.04 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  59.04 
 
 		 463 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  58.43 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  58.43 
 
 		 443 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  58.43 
 
 		 449 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  58.4 
 
 		 439 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  56.97 
 
 		 436 aa  445  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  56.19 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  56.42 
 
 		 442 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  57.07 
 
 		 442 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  56.32 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  55.86 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  56.32 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  56.32 
 
 		 442 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  56.91 
 
 		 429 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  55.02 
 
 		 441 aa  433  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  52.67 
 
 		 437 aa  434  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.7 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  54.24 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  52.86 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.33 
 
 		 427 aa  428  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  50.96 
 
 		 439 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  51.96 
 
 		 437 aa  419  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  50.7 
 
 		 434 aa  421  1e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  53.88 
 
 		 454 aa  415  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  52.26 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  52.43 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  53.13 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  53.85 
 
 		 429 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.8 
 
 		 426 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  53.86 
 
 		 436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  52.17 
 
 		 437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  53.94 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  51.08 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  50.73 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  50.6 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  53.36 
 
 		 435 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.61 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  54.09 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  53.6 
 
 		 435 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  51.12 
 
 		 431 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.81 
 
 		 422 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  55.35 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  52.76 
 
 		 443 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  51.08 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  51.08 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  55.35 
 
 		 445 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  51.08 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  55.61 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  51.08 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  48.56 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  52.51 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  48.56 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  50.84 
 
 		 443 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  53.5 
 
 		 489 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.49 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  48.8 
 
 		 443 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.58 
 
 		 433 aa  386  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.31 
 
 		 459 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  45.41 
 
 		 442 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.5 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  47.6 
 
 		 434 aa  382  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.87 
 
 		 443 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  49.17 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  49.29 
 
 		 444 aa  383  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  48.46 
 
 		 439 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 		 449 aa  382  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.6 
 
 		 446 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.16 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  48.8 
 
 		 446 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.17 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.39 
 
 		 439 aa  378  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.64 
 
 		 452 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  48.24 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  49.52 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  53.23 
 
 		 442 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  48.67 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.06 
 
 		 455 aa  373  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  50.87 
 
 		 459 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  50.64 
 
 		 452 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  46.36 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.83 
 
 		 466 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  46.21 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  48.79 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>