More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0107 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 
429 aa  858    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  57.79 
 
 
440 aa  482  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  57.24 
 
 
440 aa  481  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  60.14 
 
 
438 aa  484  1e-135  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  58.8 
 
 
438 aa  481  1e-134  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  57.07 
 
 
440 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  56.35 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.85 
 
 
461 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.61 
 
 
462 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.85 
 
 
458 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.85 
 
 
461 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  53.85 
 
 
458 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  52.14 
 
 
442 aa  420  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  53.61 
 
 
458 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  54.29 
 
 
443 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  53.01 
 
 
449 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.34 
 
 
427 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  51.34 
 
 
438 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  50.24 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.83 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  51.72 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  52.55 
 
 
441 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.47 
 
 
442 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  51.95 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  49.76 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  52.67 
 
 
445 aa  395  1e-109  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  51.33 
 
 
436 aa  396  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  52.91 
 
 
445 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  49.04 
 
 
422 aa  397  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  52.67 
 
 
445 aa  393  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  52.21 
 
 
489 aa  390  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  52.17 
 
 
463 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  52.17 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.18 
 
 
443 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  48.43 
 
 
433 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  47.57 
 
 
434 aa  388  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  49.64 
 
 
435 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  47.99 
 
 
442 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  47.58 
 
 
431 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  47.94 
 
 
426 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  47.58 
 
 
437 aa  383  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  50.97 
 
 
449 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  48.31 
 
 
441 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.37 
 
 
439 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.22 
 
 
439 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  48.07 
 
 
442 aa  379  1e-104  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  50.97 
 
 
449 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  48.27 
 
 
437 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.57 
 
 
433 aa  380  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  50.97 
 
 
443 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  49.51 
 
 
434 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  45.32 
 
 
442 aa  378  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  51.71 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  51.21 
 
 
442 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  51.21 
 
 
429 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  51.21 
 
 
442 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  51.46 
 
 
442 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  51.45 
 
 
442 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  51.21 
 
 
442 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.18 
 
 
446 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  46.32 
 
 
443 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  48.93 
 
 
435 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.7 
 
 
435 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  46.88 
 
 
442 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.93 
 
 
441 aa  366  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  45.84 
 
 
443 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  48.08 
 
 
443 aa  367  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  45.24 
 
 
434 aa  366  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  49.15 
 
 
435 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  45.48 
 
 
434 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  45.31 
 
 
432 aa  364  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.19 
 
 
449 aa  365  1e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  44.08 
 
 
443 aa  363  4e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.49 
 
 
459 aa  362  6e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  46.57 
 
 
434 aa  361  1e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  47.19 
 
 
433 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  47.19 
 
 
433 aa  359  5e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  47.31 
 
 
441 aa  359  6e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  47.19 
 
 
433 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  47.19 
 
 
433 aa  358  8e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5207  ATPase, FliI/YscN family  48.22 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  45.52 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  47.28 
 
 
443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  50.88 
 
 
449 aa  355  5.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.24 
 
 
474 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  46.34 
 
 
439 aa  354  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  45.84 
 
 
480 aa  354  2e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  45.32 
 
 
435 aa  353  4e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  44.71 
 
 
456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  50.51 
 
 
449 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  45.17 
 
 
452 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  47.65 
 
 
450 aa  351  1e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  44.84 
 
 
485 aa  351  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.17 
 
 
452 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  45.89 
 
 
472 aa  350  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  45.9 
 
 
453 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  43.7 
 
 
436 aa  350  4e-95  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  45.41 
 
 
459 aa  349  6e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  45.7 
 
 
446 aa  349  6e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>