More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0413 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  100 
 
 
441 aa  887    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  81.52 
 
 
434 aa  726    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  83.22 
 
 
443 aa  749    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  92.52 
 
 
443 aa  837    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  79.12 
 
 
432 aa  694    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  81.52 
 
 
434 aa  725    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  78.67 
 
 
439 aa  706    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  67.82 
 
 
433 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  58.49 
 
 
437 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  58.78 
 
 
437 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  59.71 
 
 
441 aa  498  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  58.13 
 
 
435 aa  499  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  57.67 
 
 
437 aa  498  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  57.41 
 
 
437 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  57.44 
 
 
442 aa  494  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  58 
 
 
436 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  56.67 
 
 
433 aa  480  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  55.17 
 
 
439 aa  478  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  54.71 
 
 
454 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  54.81 
 
 
438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  55.29 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  56.48 
 
 
442 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  55.71 
 
 
431 aa  462  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  58.17 
 
 
436 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  55.42 
 
 
449 aa  460  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  54.15 
 
 
441 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  55.42 
 
 
426 aa  456  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  60.15 
 
 
437 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  54.02 
 
 
434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  53.25 
 
 
442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  57.25 
 
 
440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  54.74 
 
 
443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  50.64 
 
 
504 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  56.63 
 
 
468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  53 
 
 
434 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  51.9 
 
 
440 aa  438  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  51.17 
 
 
440 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.29 
 
 
489 aa  440  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  55.21 
 
 
422 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  51.87 
 
 
440 aa  436  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.26 
 
 
474 aa  434  1e-120  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  54.4 
 
 
448 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.72 
 
 
450 aa  428  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  52.52 
 
 
442 aa  426  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.69 
 
 
439 aa  426  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  49.45 
 
 
487 aa  421  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  52.36 
 
 
439 aa  421  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  52.11 
 
 
441 aa  421  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.67 
 
 
458 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  51.18 
 
 
443 aa  419  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  50.71 
 
 
463 aa  420  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.78 
 
 
438 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  50.11 
 
 
472 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.47 
 
 
438 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 
453 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  47.26 
 
 
443 aa  408  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  49.56 
 
 
466 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  48.69 
 
 
446 aa  409  1e-113  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  50.12 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.76 
 
 
480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  50.82 
 
 
434 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  48.72 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.12 
 
 
442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.99 
 
 
449 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.61 
 
 
449 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
437 aa  405  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.37 
 
 
445 aa  402  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  48.52 
 
 
471 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  49.44 
 
 
465 aa  404  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  46.98 
 
 
436 aa  402  1e-111  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  49.66 
 
 
451 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  48.29 
 
 
470 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.81 
 
 
485 aa  404  1e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.87 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  49.89 
 
 
452 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  49.64 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  49.64 
 
 
458 aa  399  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  49.54 
 
 
451 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  49.44 
 
 
481 aa  398  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  49.76 
 
 
439 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.36 
 
 
452 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  50.36 
 
 
452 aa  396  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  49.21 
 
 
468 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  48.61 
 
 
470 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  52.06 
 
 
460 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  49.21 
 
 
451 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  48.13 
 
 
435 aa  396  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  48.98 
 
 
479 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  52.53 
 
 
449 aa  396  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  50.36 
 
 
452 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  396  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  48.98 
 
 
479 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  49.04 
 
 
461 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  48.1 
 
 
448 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.3 
 
 
459 aa  396  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  50.11 
 
 
547 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  50.94 
 
 
445 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  49.2 
 
 
451 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  48.53 
 
 
478 aa  392  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>