More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1218 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  100 
 
 
474 aa  954    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  57.48 
 
 
426 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  57.63 
 
 
422 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  56.28 
 
 
437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  54.63 
 
 
442 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  53.46 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  54.61 
 
 
427 aa  456  1e-127  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  53.72 
 
 
437 aa  456  1e-127  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  53.81 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  53.74 
 
 
433 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  56.28 
 
 
436 aa  452  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  54.29 
 
 
431 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  54.52 
 
 
439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  53.86 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  53.02 
 
 
442 aa  450  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  53.35 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.97 
 
 
433 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  54.05 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  53.24 
 
 
489 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.69 
 
 
454 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  53.23 
 
 
434 aa  438  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  52.42 
 
 
443 aa  437  1e-121  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.26 
 
 
441 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  51.27 
 
 
441 aa  434  1e-120  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  51.33 
 
 
485 aa  434  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  53.18 
 
 
439 aa  429  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  53.25 
 
 
436 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  52.33 
 
 
443 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  51.28 
 
 
449 aa  425  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.27 
 
 
450 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  50.46 
 
 
434 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  51.4 
 
 
443 aa  422  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  50.69 
 
 
434 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  51.64 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  50.11 
 
 
448 aa  412  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  52.05 
 
 
440 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.35 
 
 
435 aa  415  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  46.67 
 
 
436 aa  414  1e-114  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 
438 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.82 
 
 
438 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  46.64 
 
 
504 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  50.47 
 
 
439 aa  409  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  50.23 
 
 
441 aa  406  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  51.67 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  51.43 
 
 
437 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
468 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  49.77 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  47.72 
 
 
453 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  48.6 
 
 
440 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  48.25 
 
 
446 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  48.59 
 
 
441 aa  394  1e-108  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  48.8 
 
 
466 aa  393  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  48.31 
 
 
442 aa  392  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  47.92 
 
 
440 aa  394  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.4 
 
 
460 aa  393  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  47.47 
 
 
451 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  48.26 
 
 
460 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 
441 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  48.01 
 
 
454 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  46.87 
 
 
437 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  47.54 
 
 
440 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  48.36 
 
 
440 aa  389  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  47.73 
 
 
442 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  47.1 
 
 
439 aa  388  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  48.35 
 
 
441 aa  385  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  47.26 
 
 
452 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  47.16 
 
 
465 aa  385  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  44.98 
 
 
464 aa  384  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  48.56 
 
 
439 aa  384  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  45.81 
 
 
472 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  50.53 
 
 
459 aa  381  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  48.48 
 
 
446 aa  379  1e-104  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  45.69 
 
 
434 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  46.48 
 
 
441 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  46.05 
 
 
487 aa  381  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  44.75 
 
 
445 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  48.43 
 
 
435 aa  380  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  48.44 
 
 
452 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  47.92 
 
 
441 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.99 
 
 
452 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  46.99 
 
 
452 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  44.52 
 
 
445 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  48.22 
 
 
475 aa  376  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  44.52 
 
 
445 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  46.37 
 
 
441 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  45.87 
 
 
448 aa  378  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  46.54 
 
 
451 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  48.1 
 
 
435 aa  377  1e-103  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  46.88 
 
 
463 aa  377  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  46.67 
 
 
445 aa  378  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.25 
 
 
449 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50 
 
 
449 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  45.48 
 
 
449 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.41 
 
 
480 aa  372  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  44.83 
 
 
435 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  49.76 
 
 
433 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  45.9 
 
 
453 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  46.78 
 
 
448 aa  372  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  46.05 
 
 
459 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>