More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3835 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  81.52 
 
 		 441 aa  725    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 		 434 aa  874    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  81.29 
 
 		 443 aa  726    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  84.76 
 
 		 443 aa  757    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  78.89 
 
 		 432 aa  706    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  78.75 
 
 		 439 aa  711    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  99.54 
 
 		 434 aa  872    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  65.51 
 
 		 433 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  57.51 
 
 		 437 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  58.02 
 
 		 437 aa  510  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  58.12 
 
 		 435 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  58.57 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  56.97 
 
 		 437 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  57.18 
 
 		 437 aa  503  1e-141  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  58.74 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  56.18 
 
 		 442 aa  497  1e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  57.34 
 
 		 442 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  57.18 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  55.63 
 
 		 434 aa  483  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  58.85 
 
 		 449 aa  481  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  54.59 
 
 		 454 aa  480  1e-134  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  56.16 
 
 		 431 aa  471  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  54.57 
 
 		 438 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  52.53 
 
 		 439 aa  469  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  54.73 
 
 		 441 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  54.81 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  58.45 
 
 		 436 aa  468  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  54.83 
 
 		 434 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  57.97 
 
 		 440 aa  458  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  55.18 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  54.61 
 
 		 422 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  57.41 
 
 		 468 aa  450  1e-125  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.88 
 
 		 489 aa  448  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  58.23 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  53.81 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  50.96 
 
 		 442 aa  443  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  51.61 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  52.25 
 
 		 439 aa  441  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  55.09 
 
 		 448 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  50 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  56.83 
 
 		 450 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 		 443 aa  435  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  50.48 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  51.56 
 
 		 442 aa  431  1e-119  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  51.08 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  51.75 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  51.06 
 
 		 438 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  50.91 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  52.16 
 
 		 458 aa  427  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.69 
 
 		 474 aa  424  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  49.12 
 
 		 487 aa  422  1e-117  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  50.68 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.76 
 
 		 480 aa  421  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  51.29 
 
 		 438 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  48.95 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  48.69 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  51.58 
 
 		 439 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  50.24 
 
 		 463 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  49.64 
 
 		 458 aa  408  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  50.12 
 
 		 434 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1649  ATPase FliI/YscN  48.72 
 
 		 437 aa  408  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.671918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.19 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  49.53 
 
 		 453 aa  409  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  50.35 
 
 		 442 aa  411  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.67 
 
 		 485 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.88 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.08 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  48.94 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  48.97 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 		 451 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 		 458 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.53 
 
 		 464 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.49 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1721  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.49 
 
 		 449 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  48.02 
 
 		 435 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  48.17 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  49.52 
 
 		 437 aa  404  1e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1116  flagellar protein export ATPase FliI  48.85 
 
 		 470 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  49.32 
 
 		 481 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  49.1 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  48.02 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  48.64 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  49.4 
 
 		 448 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  49.1 
 
 		 479 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  49.18 
 
 		 451 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  48.92 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  49.77 
 
 		 547 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  48.47 
 
 		 451 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  48.69 
 
 		 445 aa  395  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  49.04 
 
 		 462 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  51.49 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  49.16 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  50.25 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 		 439 aa  393  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  45.89 
 
 		 458 aa  392  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  46.4 
 
 		 456 aa  392  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0495  flagellar protein export ATPase FliI  51.98 
 
 		 449 aa  395  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>