More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0041 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1400  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  84.51 
 
 		 449 aa  732    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1213  type III secretion cytoplasmic ATPase HrcN  84.51 
 
 		 449 aa  727    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.66508  normal  0.984942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0041  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 		 452 aa  905    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2208  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  66.97 
 
 		 455 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1889  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  65.61 
 
 		 459 aa  547  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  53.38 
 
 		 440 aa  425  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  52.38 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0041  type III secretion system ATPase  51.41 
 
 		 439 aa  405  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  52.07 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  52.03 
 
 		 442 aa  404  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  50.59 
 
 		 438 aa  398  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  51.62 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  49.76 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  45.13 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  50.93 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  44.89 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.6 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  50.34 
 
 		 449 aa  379  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  45.02 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2288  type III secretion system ATPase  50.55 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0274161  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0686  type III secretion system ATPase  50.55 
 
 		 442 aa  375  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.14 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1948  type III secretion system ATPase  50.66 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0744  type III secretion system ATPase  50.22 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605501  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2205  type III secretion system ATPase  50.66 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.937214  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  47.91 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  47.91 
 
 		 461 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  48.14 
 
 		 458 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  46.39 
 
 		 431 aa  376  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0627  type III secretion system ATPase  50.66 
 
 		 442 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1637  type III secretion system ATPase  51.26 
 
 		 429 aa  375  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.907446  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  47.91 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  45.86 
 
 		 442 aa  367  1e-100  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1758  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00305605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1526  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.422026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1511  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.612036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  43.86 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1548  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 433 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  46.56 
 
 		 441 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  42.26 
 
 		 434 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1928  type III secretion system ATPase  49.53 
 
 		 443 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.805786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3933  type III secretion system ATPase  48.11 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3818  type III secretion system ATPase  47.88 
 
 		 445 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  46.58 
 
 		 436 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1990  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 443 aa  363  4e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0422  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 449 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0250498  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1898  type III secretion system ATPase  50.7 
 
 		 449 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284295  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3906  type III secretion system ATPase  47.99 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  45.57 
 
 		 437 aa  360  4e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5634  type III secretion system ATPase  51.36 
 
 		 463 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  44.74 
 
 		 437 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5851  type III secretion system ATPase  51.11 
 
 		 463 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  46.48 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  41.16 
 
 		 443 aa  356  5e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0107  FliI/YscN family ATPase  49.25 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  44.72 
 
 		 441 aa  355  6.999999999999999e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  44.5 
 
 		 437 aa  355  7.999999999999999e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  41.33 
 
 		 442 aa  354  1e-96  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  44.81 
 
 		 442 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  46.24 
 
 		 443 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  43.23 
 
 		 439 aa  351  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  44.67 
 
 		 454 aa  350  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5062  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.13 
 
 		 446 aa  348  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  44.1 
 
 		 463 aa  347  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  46.21 
 
 		 441 aa  347  4e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  43.97 
 
 		 443 aa  345  7e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  44.87 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  44.94 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  46.32 
 
 		 436 aa  344  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  43.16 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.53 
 
 		 441 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  45.03 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.15 
 
 		 442 aa  343  4e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  43.02 
 
 		 443 aa  341  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  44.42 
 
 		 449 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  45.39 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  45.19 
 
 		 434 aa  339  5.9999999999999996e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  42.96 
 
 		 443 aa  338  9.999999999999999e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2562  ATPase FliI/YscN  47 
 
 		 452 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00881379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  43.13 
 
 		 434 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  44.47 
 
 		 446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2466  ATPase, FliI/YscN family  46.76 
 
 		 452 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00501836  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  45.26 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  45.52 
 
 		 450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  42.89 
 
 		 434 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.63 
 
 		 474 aa  336  5e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1391  ATPase FliI/YscN  46.81 
 
 		 452 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00127996  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  45.37 
 
 		 441 aa  336  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  44.31 
 
 		 458 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  40.89 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  44.37 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  45.39 
 
 		 446 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  45.63 
 
 		 445 aa  333  5e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  45.63 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  45.63 
 
 		 445 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  42.6 
 
 		 444 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  44.88 
 
 		 452 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  45.86 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  45.86 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  45.86 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>