More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3379 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0253  lateral flagellar export/assembly protein LfiI  99.78 
 
 
445 aa  902    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0714  flagellum-specific ATP synthase  72.36 
 
 
446 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0634  flagellum-specific ATP synthase  72.58 
 
 
446 aa  657    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3379  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 
445 aa  903    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424173  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  71.43 
 
 
438 aa  617  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  65.2 
 
 
435 aa  566  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  65.2 
 
 
435 aa  561  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  58.89 
 
 
450 aa  528  1e-149  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.33 
 
 
448 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  62.17 
 
 
435 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0231  flagellum-specific ATP synthase  60.67 
 
 
389 aa  501  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.461422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  58.64 
 
 
449 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  58.47 
 
 
445 aa  482  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  57.14 
 
 
449 aa  479  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  58.23 
 
 
447 aa  476  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  56.5 
 
 
445 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  55.45 
 
 
451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  56.4 
 
 
451 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  57.82 
 
 
446 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  56.04 
 
 
458 aa  463  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  58.02 
 
 
445 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  58.02 
 
 
445 aa  461  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  56.53 
 
 
446 aa  461  1e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  56.8 
 
 
446 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  57.84 
 
 
445 aa  461  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  56.87 
 
 
445 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  55.24 
 
 
463 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  57.07 
 
 
446 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  57.84 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  53.36 
 
 
443 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  57.77 
 
 
446 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
445 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  57.6 
 
 
445 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  56.34 
 
 
446 aa  458  1e-127  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  57.66 
 
 
444 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  56.81 
 
 
481 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  53.5 
 
 
452 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  54.55 
 
 
452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  55.86 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  55.91 
 
 
446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  55.86 
 
 
479 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  54.52 
 
 
452 aa  451  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  54.8 
 
 
448 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  54.63 
 
 
480 aa  448  1e-125  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  53.76 
 
 
547 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  51.9 
 
 
464 aa  448  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  52.69 
 
 
459 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  55.13 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  56.93 
 
 
449 aa  443  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  52.73 
 
 
439 aa  443  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  54.31 
 
 
451 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  54.31 
 
 
451 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  53.33 
 
 
452 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3562  ATPase, FliI/YscN family protein  51.05 
 
 
436 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  50.79 
 
 
456 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  52.78 
 
 
439 aa  438  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  51.73 
 
 
472 aa  435  1e-121  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  52.93 
 
 
549 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  53.53 
 
 
519 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  53 
 
 
470 aa  436  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  52.93 
 
 
552 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  53.74 
 
 
513 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  53.51 
 
 
513 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  50.79 
 
 
456 aa  437  1e-121  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  54.07 
 
 
451 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  53.53 
 
 
524 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  53.74 
 
 
513 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  53.74 
 
 
514 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  53.51 
 
 
513 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  50.67 
 
 
456 aa  435  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  51.32 
 
 
488 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.09 
 
 
439 aa  434  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.99 
 
 
509 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  51.63 
 
 
439 aa  432  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  50.88 
 
 
454 aa  434  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  55 
 
 
458 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.76 
 
 
523 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  51 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  53.76 
 
 
526 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  51 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  51 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  51.36 
 
 
486 aa  431  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  51 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  51 
 
 
456 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  52.85 
 
 
468 aa  426  1e-118  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  52.4 
 
 
478 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  55.39 
 
 
460 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  49.14 
 
 
484 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1573  flagellum-specific ATP synthase  49.89 
 
 
456 aa  422  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1091  flagella ATPase FliI  51.93 
 
 
464 aa  424  1e-117  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.756512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  50.23 
 
 
457 aa  422  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  48.92 
 
 
472 aa  423  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
457 aa  421  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>