More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3656 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  82.77 
 
 		 449 aa  736    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  79.35 
 
 		 447 aa  690    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  75.64 
 
 		 445 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  100 
 
 		 445 aa  900    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  81.72 
 
 		 449 aa  733    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  59.57 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  58.12 
 
 		 463 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  58.49 
 
 		 450 aa  499  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  58.49 
 
 		 448 aa  499  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  60.66 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  62.08 
 
 		 445 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  58.53 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  60.52 
 
 		 446 aa  488  1e-137  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  60.71 
 
 		 446 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  60.38 
 
 		 446 aa  489  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  487  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  59.67 
 
 		 446 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  61.11 
 
 		 445 aa  485  1e-136  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  61.08 
 
 		 446 aa  482  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02886  flagellum-specific ATP synthase  57.61 
 
 		 444 aa  478  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.759484  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  56.76 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3379  FliI/YscN family ATPase  56.5 
 
 		 445 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  57.85 
 
 		 451 aa  476  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  56.5 
 
 		 438 aa  478  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  56.84 
 
 		 480 aa  475  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  57.85 
 
 		 451 aa  477  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0253  lateral flagellar export/assembly protein LfiI  57.14 
 
 		 445 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.67 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  55.61 
 
 		 464 aa  473  1e-132  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  56.67 
 
 		 452 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  55.83 
 
 		 488 aa  471  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  56.45 
 
 		 454 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  57.44 
 
 		 547 aa  471  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  56.05 
 
 		 444 aa  471  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  56.64 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  58.13 
 
 		 452 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  56.12 
 
 		 470 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  56.91 
 
 		 451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  56.88 
 
 		 451 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  56.44 
 
 		 448 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  57.59 
 
 		 458 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  58.47 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  57.14 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  57.14 
 
 		 514 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0714  flagellum-specific ATP synthase  56.57 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0634  flagellum-specific ATP synthase  56.57 
 
 		 446 aa  470  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  56.68 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  54.46 
 
 		 472 aa  468  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.97 
 
 		 439 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  56.54 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  56.54 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  57.38 
 
 		 456 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  57.14 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  56.68 
 
 		 513 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  57.14 
 
 		 513 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  58.14 
 
 		 549 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  56.54 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  56.54 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  56.54 
 
 		 456 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  57.14 
 
 		 456 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  56.98 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  56.91 
 
 		 519 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  56.26 
 
 		 435 aa  461  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  57.18 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  57.21 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  56.74 
 
 		 439 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  57.18 
 
 		 479 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  56.63 
 
 		 439 aa  462  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  57.28 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  56.22 
 
 		 526 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  55.73 
 
 		 459 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3064  flagellar protein export ATPase FliI  56.61 
 
 		 524 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  58.51 
 
 		 458 aa  461  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  56.22 
 
 		 466 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  56.29 
 
 		 481 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  55.56 
 
 		 456 aa  457  1e-127  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.22 
 
 		 509 aa  457  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1958  ATPase FliI/YscN  57.94 
 
 		 468 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.191624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  55.42 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  56.22 
 
 		 523 aa  458  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  56.02 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  54.61 
 
 		 487 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1243  flagellum-specific ATP synthase  56.02 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  56.02 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  56.73 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  56.73 
 
 		 458 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1701  flagellum-specific ATP synthase  56.02 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0163805 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  55.56 
 
 		 435 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  56.02 
 
 		 457 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>