More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2671 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  80.93 
 
 
468 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  79.35 
 
 
440 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  71.16 
 
 
504 aa  658    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  100 
 
 
437 aa  877    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  73.6 
 
 
448 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  61.59 
 
 
433 aa  496  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  58.03 
 
 
439 aa  478  1e-134  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  60.15 
 
 
441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  58.25 
 
 
432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  56.31 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  58.98 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  55.82 
 
 
437 aa  468  9.999999999999999e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  59.16 
 
 
443 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  55.45 
 
 
489 aa  458  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  58.23 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  59.4 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  58.23 
 
 
434 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  57.87 
 
 
433 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  55.92 
 
 
449 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  52.34 
 
 
443 aa  452  1.0000000000000001e-126  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  52.24 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  56.69 
 
 
454 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  55.88 
 
 
436 aa  451  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  52.71 
 
 
437 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  55.26 
 
 
422 aa  450  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  54.05 
 
 
426 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  53.61 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  53.41 
 
 
442 aa  445  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  52.97 
 
 
437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  54.46 
 
 
431 aa  444  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  51.65 
 
 
434 aa  444  1e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  56.35 
 
 
441 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  53.62 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  53.38 
 
 
438 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  57.43 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  52.66 
 
 
434 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  56.46 
 
 
436 aa  432  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  53.07 
 
 
453 aa  429  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  48.94 
 
 
442 aa  428  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  55.26 
 
 
443 aa  425  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  50.79 
 
 
464 aa  425  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  51.43 
 
 
474 aa  422  1e-117  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.05 
 
 
450 aa  424  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  52.26 
 
 
441 aa  418  1e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  49.44 
 
 
472 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  52 
 
 
435 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  50.22 
 
 
472 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 
478 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.3 
 
 
439 aa  411  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.91 
 
 
459 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  51.16 
 
 
442 aa  402  1e-111  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  53.25 
 
 
441 aa  402  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  50.78 
 
 
552 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  50.36 
 
 
439 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  51.44 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  52.87 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  52.87 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  52.1 
 
 
547 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  50.78 
 
 
549 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  52.87 
 
 
445 aa  402  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  52.12 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  47.02 
 
 
485 aa  401  9.999999999999999e-111  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  52.87 
 
 
445 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  47.49 
 
 
452 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  50.22 
 
 
488 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1603  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase FliI  50.67 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  49.41 
 
 
439 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  49.54 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  53.4 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  47.87 
 
 
440 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  51.43 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  51.15 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0393  flagellum-specific ATP synthase  49.78 
 
 
481 aa  397  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.948849  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  49.16 
 
 
439 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  52.99 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.26 
 
 
452 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  50.11 
 
 
459 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  50.56 
 
 
526 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  50.81 
 
 
514 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  50.34 
 
 
519 aa  398  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  52.99 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.51 
 
 
439 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.78 
 
 
509 aa  395  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.56 
 
 
523 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  49.19 
 
 
446 aa  397  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  52.99 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  50.81 
 
 
513 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  51.08 
 
 
458 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  50.58 
 
 
513 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4728  flagellar protein export ATPase FliI  50.46 
 
 
479 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.696414  normal  0.0278522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  50.81 
 
 
513 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3651  ATPase, FliI/YscN family  50.46 
 
 
479 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.801513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  48.94 
 
 
463 aa  396  1e-109  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  52.99 
 
 
445 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>