More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2024 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
446 aa  881    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  69.93 
 
 
459 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  64.71 
 
 
446 aa  532  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  60.32 
 
 
439 aa  495  1e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  60.89 
 
 
435 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  58.8 
 
 
453 aa  468  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  55.84 
 
 
439 aa  451  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  57.78 
 
 
435 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  51.81 
 
 
437 aa  432  1e-120  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.7 
 
 
439 aa  429  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.42 
 
 
426 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.72 
 
 
443 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  54.68 
 
 
436 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  51.31 
 
 
437 aa  421  1e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  49.2 
 
 
437 aa  421  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.63 
 
 
422 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  50.57 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  49.65 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  47.61 
 
 
434 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
427 aa  414  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  52.44 
 
 
436 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  50.97 
 
 
441 aa  410  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  53.77 
 
 
489 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.69 
 
 
454 aa  410  1e-113  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  51.59 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  46.81 
 
 
442 aa  403  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  48.94 
 
 
434 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.05 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  51.31 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  51.08 
 
 
449 aa  401  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  48.43 
 
 
431 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0140  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 
436 aa  396  1e-109  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  49.66 
 
 
441 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  49.15 
 
 
442 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  50 
 
 
441 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  49.76 
 
 
443 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  50.56 
 
 
441 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  50.12 
 
 
463 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
437 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  51.06 
 
 
446 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.48 
 
 
474 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  52.67 
 
 
434 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  49.77 
 
 
450 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  48.23 
 
 
434 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  53.3 
 
 
468 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.67 
 
 
443 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  50.48 
 
 
443 aa  377  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.51 
 
 
435 aa  378  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  47.67 
 
 
434 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  48.36 
 
 
440 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  48.58 
 
 
446 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  49.19 
 
 
441 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  50 
 
 
440 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  47.82 
 
 
446 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  50.12 
 
 
432 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  48.71 
 
 
439 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  46.52 
 
 
504 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  47.75 
 
 
443 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  51.57 
 
 
435 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  50.26 
 
 
441 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  49.41 
 
 
446 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.71 
 
 
454 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.79 
 
 
448 aa  364  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  50.67 
 
 
443 aa  363  4e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  49.74 
 
 
440 aa  363  4e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  49.87 
 
 
445 aa  362  5.0000000000000005e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  47.43 
 
 
441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  46.5 
 
 
439 aa  362  9e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  47.87 
 
 
451 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.24 
 
 
451 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  51.82 
 
 
435 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.03 
 
 
439 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  51.57 
 
 
435 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  51.45 
 
 
453 aa  360  4e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  49.66 
 
 
478 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  46.81 
 
 
448 aa  360  4e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  360  4e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  46.85 
 
 
442 aa  360  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  47.56 
 
 
451 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  46.56 
 
 
439 aa  359  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  359  5e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  47.63 
 
 
451 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  47.63 
 
 
451 aa  358  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  48.22 
 
 
446 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2435  type III secretion system ATPase  50.82 
 
 
438 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
452 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  49.08 
 
 
440 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  48.8 
 
 
458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  48.8 
 
 
458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2988  type III secretion system ATPase  49.61 
 
 
438 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  50.92 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  47.37 
 
 
446 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.35 
 
 
452 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  49.74 
 
 
441 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  50.92 
 
 
451 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>