More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0823 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  99.33 
 
 
451 aa  875    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  85.38 
 
 
453 aa  738    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  97.56 
 
 
452 aa  831    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
451 aa  880    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  88.43 
 
 
450 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  85.38 
 
 
451 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  69.23 
 
 
441 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  70.39 
 
 
441 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  69.93 
 
 
441 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  68.41 
 
 
440 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  69.25 
 
 
441 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  69.98 
 
 
441 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  68.6 
 
 
454 aa  598  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  64.85 
 
 
445 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  60.6 
 
 
475 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  61.16 
 
 
448 aa  501  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  59.64 
 
 
445 aa  501  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  54.73 
 
 
455 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  52.13 
 
 
422 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  54.03 
 
 
450 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  47.69 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  50.91 
 
 
441 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  49.05 
 
 
431 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  50.46 
 
 
433 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  52.11 
 
 
453 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  48.28 
 
 
442 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  48.98 
 
 
440 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  47.07 
 
 
437 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  48.24 
 
 
437 aa  386  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  50.45 
 
 
437 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  45.01 
 
 
434 aa  382  1e-105  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  51.65 
 
 
436 aa  382  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  48.19 
 
 
448 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  48.8 
 
 
454 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  48.71 
 
 
433 aa  379  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  46.19 
 
 
437 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  46.51 
 
 
439 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  46.35 
 
 
443 aa  379  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  46.56 
 
 
437 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.61 
 
 
441 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  49.41 
 
 
436 aa  375  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  47.92 
 
 
468 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  48.34 
 
 
441 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  47.72 
 
 
443 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  46.64 
 
 
439 aa  378  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  48.05 
 
 
432 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  49.05 
 
 
434 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.15 
 
 
443 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  49.52 
 
 
434 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  45.7 
 
 
442 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  49.04 
 
 
441 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  47.76 
 
 
449 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  49.29 
 
 
460 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  50.59 
 
 
489 aa  367  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.41 
 
 
438 aa  367  1e-100  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  48.2 
 
 
435 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  45.18 
 
 
427 aa  364  2e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  43.89 
 
 
442 aa  362  6e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  45.5 
 
 
434 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  51.28 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  51.28 
 
 
442 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  44.93 
 
 
474 aa  362  8e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  47.8 
 
 
464 aa  361  1e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  46.08 
 
 
463 aa  362  1e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  45.24 
 
 
478 aa  360  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  50.99 
 
 
439 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  47.66 
 
 
435 aa  358  8e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.42 
 
 
459 aa  358  9e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  44.35 
 
 
504 aa  358  9e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  46.33 
 
 
480 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.2 
 
 
443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  50.77 
 
 
442 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  46.8 
 
 
552 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  48.76 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  48.76 
 
 
514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  45.31 
 
 
451 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  48.76 
 
 
513 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  46.97 
 
 
547 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  48.56 
 
 
519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  50.92 
 
 
446 aa  357  2.9999999999999997e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  45.73 
 
 
549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1975  ATPase FliI/YscN  46.71 
 
 
472 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  50.26 
 
 
458 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3112  flagellar protein export ATPase FliI  48.34 
 
 
513 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547472  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2822  flagellum-specific ATP synthase  45.71 
 
 
448 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0128266 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2978  flagellar protein export ATPase FliI  48.34 
 
 
513 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728984 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.48 
 
 
466 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  50.71 
 
 
439 aa  354  1e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  44.87 
 
 
451 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  50.26 
 
 
446 aa  354  2e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3278  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.313514  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0197  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.42 
 
 
509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3403  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0231  flagellar protein export ATPase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0228517  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2943  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.42 
 
 
523 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.136999  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  47.8 
 
 
443 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  49.42 
 
 
526 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  47.43 
 
 
441 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>