More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3370 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  84.58 
 
 
440 aa  761    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  89.8 
 
 
441 aa  805    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  83.71 
 
 
441 aa  764    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  83.03 
 
 
441 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  83.94 
 
 
441 aa  765    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  84.62 
 
 
441 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
454 aa  911    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  70.23 
 
 
453 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  69.79 
 
 
450 aa  608  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  68.45 
 
 
452 aa  599  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  68.6 
 
 
451 aa  597  1e-169  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  68.6 
 
 
451 aa  597  1e-169  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  66.9 
 
 
445 aa  595  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  68.76 
 
 
451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  65 
 
 
475 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  61.99 
 
 
445 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  59.55 
 
 
448 aa  516  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  54.15 
 
 
455 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  51.3 
 
 
437 aa  429  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  53.21 
 
 
422 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  51.03 
 
 
433 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.93 
 
 
431 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  52.51 
 
 
436 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.3 
 
 
426 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  51.2 
 
 
437 aa  413  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  51.06 
 
 
437 aa  409  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  52.68 
 
 
450 aa  409  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  52.16 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  50.35 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  47.98 
 
 
434 aa  403  1e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.92 
 
 
439 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  48.93 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  50.24 
 
 
436 aa  400  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  50 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  50.11 
 
 
441 aa  396  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  51.52 
 
 
439 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.03 
 
 
443 aa  393  1e-108  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.01 
 
 
474 aa  391  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.79 
 
 
438 aa  391  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  50.12 
 
 
441 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  50.24 
 
 
442 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  51.29 
 
 
489 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  45.24 
 
 
427 aa  385  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  48.42 
 
 
441 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  47.78 
 
 
433 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.8 
 
 
449 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.31 
 
 
441 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  47.51 
 
 
465 aa  384  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  47.87 
 
 
434 aa  379  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  49.77 
 
 
440 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  47.82 
 
 
435 aa  382  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  47.65 
 
 
435 aa  379  1e-104  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  49.1 
 
 
448 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  46.88 
 
 
443 aa  375  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  47.15 
 
 
504 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  47.44 
 
 
432 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49.33 
 
 
468 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  46.28 
 
 
443 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  47.02 
 
 
442 aa  372  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  47.27 
 
 
466 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  51.41 
 
 
459 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  46.6 
 
 
438 aa  373  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  46.14 
 
 
434 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  45.35 
 
 
442 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  46.82 
 
 
443 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  47.03 
 
 
463 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  51.89 
 
 
437 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  46.92 
 
 
441 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  45.9 
 
 
434 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  50.83 
 
 
446 aa  369  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  47.04 
 
 
439 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  46.26 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.39 
 
 
443 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  47.71 
 
 
446 aa  365  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  46.78 
 
 
439 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  48.64 
 
 
458 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  48.93 
 
 
439 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  43.12 
 
 
436 aa  365  1e-99  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1439  ATPase FliI/YscN  44.14 
 
 
446 aa  365  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  48.56 
 
 
445 aa  364  1e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.02 
 
 
460 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  48.09 
 
 
446 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.33 
 
 
448 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  360  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  43.6 
 
 
450 aa  360  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  45.37 
 
 
440 aa  360  4e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  47 
 
 
446 aa  359  5e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  48.46 
 
 
441 aa  359  6e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  44.47 
 
 
451 aa  358  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  46.37 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.96 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  45.94 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  47.41 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  49.18 
 
 
460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>