More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0526 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 
441 aa  884    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  82.54 
 
 
440 aa  740    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  80.91 
 
 
441 aa  734    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  82.05 
 
 
441 aa  739    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  82.27 
 
 
441 aa  748    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  89.8 
 
 
454 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  80.68 
 
 
441 aa  732    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  70.93 
 
 
453 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  71 
 
 
452 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  71.19 
 
 
450 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  70.47 
 
 
451 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  70.47 
 
 
451 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  67.74 
 
 
445 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  69.46 
 
 
451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  65.23 
 
 
475 aa  546  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  61.99 
 
 
445 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  60.91 
 
 
448 aa  521  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  54.55 
 
 
455 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  55.53 
 
 
422 aa  425  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  51.79 
 
 
437 aa  424  1e-117  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  54.81 
 
 
436 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  51.28 
 
 
431 aa  421  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 
426 aa  421  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  51.88 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  50.84 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.77 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  51.97 
 
 
453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
454 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  50.98 
 
 
436 aa  398  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  50 
 
 
437 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  46.54 
 
 
434 aa  398  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.05 
 
 
439 aa  397  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
435 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  47.87 
 
 
442 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.59 
 
 
439 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.59 
 
 
474 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  48.56 
 
 
437 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  49.08 
 
 
441 aa  392  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  51.55 
 
 
441 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  52.83 
 
 
489 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  50 
 
 
442 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  47.24 
 
 
443 aa  390  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  45.81 
 
 
438 aa  387  1e-106  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31190  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  53.05 
 
 
459 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00284782  normal  0.116005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.39 
 
 
433 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  50.46 
 
 
441 aa  386  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  48.56 
 
 
449 aa  384  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  46.73 
 
 
427 aa  382  1e-104  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  49.19 
 
 
432 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  48.17 
 
 
440 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  47.56 
 
 
443 aa  376  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49.22 
 
 
468 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.88 
 
 
441 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  46.33 
 
 
435 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  49.19 
 
 
446 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0436  flagellar protein export ATPase FliI  47.75 
 
 
465 aa  373  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00154444  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  50.95 
 
 
446 aa  373  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  50.59 
 
 
448 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  49.06 
 
 
439 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  50.71 
 
 
437 aa  375  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.34 
 
 
441 aa  372  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  47.87 
 
 
443 aa  368  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  46.15 
 
 
442 aa  370  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  47.49 
 
 
434 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  46.14 
 
 
504 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4414  FliI/YscN family ATPase  48.52 
 
 
438 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0786008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  46.59 
 
 
443 aa  364  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  45.29 
 
 
463 aa  364  2e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  46.67 
 
 
434 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  47.25 
 
 
460 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  46.58 
 
 
442 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  46.43 
 
 
434 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  43.15 
 
 
443 aa  362  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  47.27 
 
 
439 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  49.14 
 
 
439 aa  360  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0756  FliI/YscN family ATPase  49.17 
 
 
435 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  47.03 
 
 
466 aa  359  5e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  48.33 
 
 
446 aa  359  7e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  42.56 
 
 
436 aa  358  9e-98  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  43.6 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  46.28 
 
 
446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  45.07 
 
 
449 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  45.82 
 
 
439 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  45.56 
 
 
451 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  45.31 
 
 
449 aa  356  5e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3379  FliI/YscN family ATPase  45.69 
 
 
445 aa  356  5.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.424173  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0163  ATPase FliI/YscN  46.76 
 
 
552 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  47.62 
 
 
446 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0253  lateral flagellar export/assembly protein LfiI  45.45 
 
 
445 aa  355  7.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  45.13 
 
 
447 aa  354  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3773  flagellar protein export ATPase FliI  46.76 
 
 
549 aa  355  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.542284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  43.36 
 
 
450 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  43.28 
 
 
437 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  45.89 
 
 
444 aa  353  2.9999999999999997e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  45.15 
 
 
458 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  46.15 
 
 
435 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  47.66 
 
 
435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0714  flagellum-specific ATP synthase  47.07 
 
 
446 aa  352  5.9999999999999994e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  46.96 
 
 
435 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  46.26 
 
 
445 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>