More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0682 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  96.15 
 
 		 442 aa  827    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  99.77 
 
 		 442 aa  853    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  84.63 
 
 		 441 aa  701    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 442 aa  855    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  69.48 
 
 		 439 aa  595  1e-169  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  64.75 
 
 		 443 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  67.27 
 
 		 449 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  63.78 
 
 		 442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  59.81 
 
 		 452 aa  479  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  59.91 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  58.11 
 
 		 465 aa  476  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  57.74 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  57.25 
 
 		 466 aa  464  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  55.66 
 
 		 464 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  57.59 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  54.61 
 
 		 537 aa  443  1e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0129  flagellum-specific ATP synthase  54.72 
 
 		 422 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  52.44 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  51.28 
 
 		 451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  51.28 
 
 		 451 aa  362  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  51.24 
 
 		 452 aa  360  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  48.77 
 
 		 475 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  46.5 
 
 		 454 aa  352  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  51.02 
 
 		 453 aa  352  8e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  46.05 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  47.49 
 
 		 455 aa  348  1e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  46.31 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  51.22 
 
 		 451 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  46.56 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  46.55 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  45.15 
 
 		 441 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  45.28 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  45.09 
 
 		 441 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  51.84 
 
 		 445 aa  333  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  47.26 
 
 		 453 aa  325  7e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  51.08 
 
 		 448 aa  321  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  41.39 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  49.84 
 
 		 431 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  46.32 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  47.16 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  45.52 
 
 		 439 aa  312  7.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  40.98 
 
 		 437 aa  309  5.9999999999999995e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  44.47 
 
 		 442 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  44.42 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  49.11 
 
 		 486 aa  308  9e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  42.24 
 
 		 447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  46.23 
 
 		 436 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  41.91 
 
 		 445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  41.86 
 
 		 450 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  50.3 
 
 		 435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  45.72 
 
 		 433 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  45.01 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  50.76 
 
 		 450 aa  306  6e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  52.04 
 
 		 439 aa  306  6e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  48.45 
 
 		 488 aa  306  7e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  42.54 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  47.06 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  49.84 
 
 		 472 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.18 
 
 		 448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0553  ATPase FliI/YscN  49.09 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  47.56 
 
 		 489 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  47.02 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  44.94 
 
 		 437 aa  302  9e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  48.59 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  41.19 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  47.72 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  46.73 
 
 		 449 aa  300  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  45.73 
 
 		 436 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.27 
 
 		 441 aa  300  5e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  41.73 
 
 		 426 aa  299  7e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  50.31 
 
 		 478 aa  298  1e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  43.57 
 
 		 422 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  48.81 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  43.28 
 
 		 435 aa  297  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  46.99 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  46.97 
 
 		 472 aa  296  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  49.85 
 
 		 446 aa  296  7e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  47.62 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  45.02 
 
 		 443 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  42.59 
 
 		 444 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  50 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  48.51 
 
 		 435 aa  294  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2293  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 		 472 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.673762  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  47.11 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  41.8 
 
 		 446 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  41.89 
 
 		 446 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0714  flagellum-specific ATP synthase  42.31 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  49.37 
 
 		 436 aa  294  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  48.31 
 
 		 446 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  42.02 
 
 		 435 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  46.39 
 
 		 466 aa  293  4e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>