More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1332 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  100 
 
 		 436 aa  836    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  85.52 
 
 		 436 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  98.85 
 
 		 436 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  60 
 
 		 442 aa  520  1e-146  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  64.02 
 
 		 444 aa  513  1e-144  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  57.7 
 
 		 450 aa  482  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  57.6 
 
 		 440 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  46.37 
 
 		 475 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  47.64 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  49.51 
 
 		 455 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  44.52 
 
 		 445 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  46.84 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 451 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  47.06 
 
 		 453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  46.26 
 
 		 450 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  42.53 
 
 		 440 aa  332  9e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  42.73 
 
 		 454 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  43.48 
 
 		 441 aa  328  8e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  44.31 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  41.9 
 
 		 441 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  43.48 
 
 		 445 aa  318  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  42.48 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  46.23 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  42.13 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  48.45 
 
 		 442 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  46.23 
 
 		 442 aa  316  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  44.79 
 
 		 442 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  40.43 
 
 		 426 aa  312  9e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  42.22 
 
 		 422 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  45.14 
 
 		 464 aa  309  5e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  46.99 
 
 		 435 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  42.52 
 
 		 466 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  44.94 
 
 		 451 aa  306  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  44.47 
 
 		 436 aa  305  8.000000000000001e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  46.52 
 
 		 453 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  42.29 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  40.19 
 
 		 437 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  40.79 
 
 		 431 aa  302  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  44.15 
 
 		 465 aa  300  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  45.22 
 
 		 439 aa  300  5e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  41.15 
 
 		 433 aa  298  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  39.17 
 
 		 436 aa  297  3e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  45.26 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.41 
 
 		 474 aa  295  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  44.28 
 
 		 489 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  39.59 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  42.11 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  38.19 
 
 		 443 aa  291  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  41.51 
 
 		 439 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  45.66 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  46.07 
 
 		 439 aa  289  7e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2267  ATPase, FliI/YscN family  47.24 
 
 		 435 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.498398  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0463  type III secretion system ATPase  41.92 
 
 		 442 aa  289  9e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.927889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  39.38 
 
 		 472 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  45.3 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.9 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1596  ATPase FliI/YscN  46.71 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.298419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2355  ATPase, FliI/YscN family  46.3 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.452621  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  42.6 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  42.6 
 
 		 458 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  40.69 
 
 		 437 aa  287  2e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3747  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.66 
 
 		 462 aa  288  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0244432  hitchhiker  0.0084294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  40.84 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  39.57 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  41.86 
 
 		 439 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  48.1 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5437  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.56 
 
 		 458 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0824968  normal  0.11706 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  41.65 
 
 		 435 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4222  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.66 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0682541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  42.36 
 
 		 454 aa  286  5.999999999999999e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 456 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  40.73 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4847  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  43.56 
 
 		 458 aa  286  7e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000294494  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  41.86 
 
 		 439 aa  285  9e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3519  ATP synthase FliI/YscN  43.56 
 
 		 458 aa  285  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0444271  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  39.54 
 
 		 454 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  38.63 
 
 		 485 aa  285  1.0000000000000001e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4744  type III secretion apparatus H+-transporting two-sector ATPase  42.66 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.740694  normal  0.643408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03396  type III secretion system ATPase  40.05 
 
 		 442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  43.03 
 
 		 467 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2216  FliI/YscN family ATPase  45.83 
 
 		 434 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.795343  hitchhiker  0.0050905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1970  type III secretion system ATPase  40.93 
 
 		 443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  45 
 
 		 486 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  46.15 
 
 		 488 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3656  ATPase FliI/YscN  39.53 
 
 		 445 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  42.78 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  44.17 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  41.34 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  43.88 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  45.06 
 
 		 445 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  41.39 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  42.34 
 
 		 446 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  45.06 
 
 		 445 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  45.06 
 
 		 445 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2274  type III secretion system ATPase  40.93 
 
 		 443 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.356768  normal  0.801039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>