More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2274 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2274  ATPase, FliI/YscN family  100 
 
 
460 aa  902    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.776813  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  53.23 
 
 
437 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  50.67 
 
 
431 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  53.21 
 
 
426 aa  436  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  54.79 
 
 
436 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  51.37 
 
 
422 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  50.93 
 
 
437 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  50.92 
 
 
438 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  54.69 
 
 
433 aa  423  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2048  ATPase FliI/YscN  52.04 
 
 
437 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  53.36 
 
 
441 aa  420  1e-116  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  52.35 
 
 
437 aa  415  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1189  flagellum-specific ATP synthase FliI  53.25 
 
 
433 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3109  ATPase FliI/YscN  54.07 
 
 
443 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3919  ATPase, FliI/YscN family  51.72 
 
 
434 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.085289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3301  flagellar protein export ATPase FliI  52.46 
 
 
432 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  51.06 
 
 
427 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  50.57 
 
 
434 aa  414  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3835  flagellar protein export ATPase FliI  51.49 
 
 
434 aa  414  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  53.73 
 
 
442 aa  414  1e-114  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4210  flagellar protein export ATPase FliI  53.61 
 
 
443 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0272  flagellar protein export ATPase FliI  52.98 
 
 
449 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.264759  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3429  flagellar protein export ATPase FliI  50.33 
 
 
439 aa  414  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  54.17 
 
 
436 aa  412  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0413  flagellum-specific ATP synthase FliI  52.06 
 
 
441 aa  411  1e-113  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.26 
 
 
474 aa  409  1e-113  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  49.88 
 
 
439 aa  408  1e-113  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  53.25 
 
 
443 aa  409  1e-113  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  51.76 
 
 
489 aa  408  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1762  flagellar protein export ATPase FliI  52.12 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  54.39 
 
 
441 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  50.94 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1569  ATPase FliI/YscN  45.47 
 
 
504 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342956  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1376  flagellar protein export ATPase FliI  47.92 
 
 
442 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0350  ATPase FliI/YscN  49.09 
 
 
440 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  52.42 
 
 
443 aa  395  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  48.97 
 
 
434 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0360  ATPase, FliI/YscN family  48.28 
 
 
485 aa  397  1e-109  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000035619  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2290  flagellar protein export ATPase FliI  49.89 
 
 
468 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0040  type III secretion system ATPase  50.11 
 
 
442 aa  389  1e-107  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  51.57 
 
 
441 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2671  flagellar protein export ATPase FliI  50.7 
 
 
437 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0572  flagellar protein export ATPase FliI  50.72 
 
 
435 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  53.33 
 
 
450 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  48.86 
 
 
456 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  49.77 
 
 
456 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  50.24 
 
 
439 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  48.86 
 
 
456 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  49.65 
 
 
463 aa  383  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01730  type III secretion system ATPase  49.88 
 
 
440 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3032  ATPase, FliI/YscN family  50.58 
 
 
448 aa  380  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0453868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  50.86 
 
 
439 aa  379  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  47.63 
 
 
456 aa  378  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  48.56 
 
 
443 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  50 
 
 
439 aa  377  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  47.25 
 
 
486 aa  376  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  49.55 
 
 
441 aa  378  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  47.05 
 
 
454 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  47.95 
 
 
445 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003366  Type III secretion cytoplasmic ATP synthase  49.3 
 
 
440 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  49.18 
 
 
454 aa  373  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42570  type III secretion system ATPase  51.09 
 
 
440 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.392052  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  50.34 
 
 
439 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  48.97 
 
 
439 aa  374  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  48.26 
 
 
440 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1966  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  51.44 
 
 
460 aa  372  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1501  flagellum-specific ATP synthase  48.74 
 
 
451 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.351897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  48.57 
 
 
488 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1573  flagellum-specific ATP synthase  50 
 
 
456 aa  372  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 
441 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3691  flagellum-specific ATP synthase  48.29 
 
 
452 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.625099  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  48.17 
 
 
458 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24200  Flagellum-specific ATPase  47.59 
 
 
459 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00829367  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  48.83 
 
 
457 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4366  flagellum-specific ATP synthase  48.51 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.821632  normal  0.648773 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 
457 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1961  flagellum-specific ATP synthase FliI  48.75 
 
 
452 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.341576  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3454  flagellum-specific ATP synthase  48.52 
 
 
452 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  48.23 
 
 
441 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0414  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
526 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.26287  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1539  flagellum-specific ATP synthase  48.53 
 
 
452 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3927  flagellum-specific ATP synthase  48.51 
 
 
451 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.84184  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6416  ATPase FliI/YscN  49.21 
 
 
519 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.853929 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2950  flagellum-specific ATP synthase  49.88 
 
 
453 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1640  flagellar protein export ATPase FliI  43.72 
 
 
437 aa  365  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.117253  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4267  flagellum-specific ATP synthase  48.5 
 
 
451 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.540128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2717  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 
457 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.437776 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1701  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 
457 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0163805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2453  flagellar protein export ATPase FliI  49.33 
 
 
513 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0279683  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3086  flagellar protein export ATPase FliI  49.33 
 
 
514 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0810317  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50100  flagellum-specific ATP synthase  48.27 
 
 
451 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0131838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3067  flagellar protein export ATPase FliI  49.33 
 
 
513 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0128753  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 
457 aa  365  1e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2145  flagellum-specific ATP synthase FliI  49.77 
 
 
523 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.741139  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0219  flagellar protein export ATPase FliI  49.77 
 
 
523 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.114937  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  49.76 
 
 
446 aa  364  1e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>