More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2599 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  85.52 
 
 
436 aa  698    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  100 
 
 
436 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  86.21 
 
 
436 aa  693    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  64.35 
 
 
444 aa  518  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  58.35 
 
 
442 aa  503  1e-141  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  57.44 
 
 
450 aa  487  1e-136  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  57.14 
 
 
440 aa  471  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  44.73 
 
 
475 aa  363  2e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  47.73 
 
 
455 aa  348  9e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  44.14 
 
 
445 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  43.35 
 
 
440 aa  341  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  46.71 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  46.82 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  42.63 
 
 
454 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  46.12 
 
 
453 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  46.81 
 
 
450 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  45.63 
 
 
448 aa  330  3e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  42.99 
 
 
441 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  43.59 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  44.75 
 
 
441 aa  325  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  43.44 
 
 
441 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  42.96 
 
 
441 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  44.37 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  45.73 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  45.73 
 
 
442 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  41.43 
 
 
431 aa  312  9e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  43.87 
 
 
422 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  42.23 
 
 
426 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  46.12 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  45.82 
 
 
442 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  41.88 
 
 
445 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  44.94 
 
 
465 aa  305  7e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  45.25 
 
 
436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  43.51 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  39.39 
 
 
436 aa  301  1e-80  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  39.14 
 
 
443 aa  301  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  43.53 
 
 
451 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  40.83 
 
 
433 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2578  flagellum-specific ATP synthase  41.09 
 
 
456 aa  298  9e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.21202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  39.61 
 
 
437 aa  298  9e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  40.32 
 
 
456 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1888  flagellum-specific ATP synthase  40.94 
 
 
456 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  40.81 
 
 
454 aa  296  4e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  39.95 
 
 
474 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  41.85 
 
 
439 aa  295  1e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  42.64 
 
 
466 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  40.79 
 
 
456 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  40.79 
 
 
456 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  40.79 
 
 
456 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  40.79 
 
 
456 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  40.79 
 
 
456 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  41.91 
 
 
465 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  40.94 
 
 
439 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  40.18 
 
 
472 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  44.31 
 
 
435 aa  292  9e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  43.89 
 
 
453 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  41.79 
 
 
439 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  43.25 
 
 
449 aa  291  2e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  41.11 
 
 
444 aa  291  2e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  39.7 
 
 
446 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2174  flagellum-specific ATP synthase  41.55 
 
 
457 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.136515  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1707  ATPase, FliI/YscN family  41.55 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.883446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1701  flagellum-specific ATP synthase  41.55 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0163805 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0691  ATPase, FliI/YscN family  41.87 
 
 
441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0468  flagellar protein export ATPase FliI  40.05 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2041  flagellum-specific ATP synthase  41.55 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2717  flagellum-specific ATP synthase  41.55 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.437776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  43.48 
 
 
458 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  43.48 
 
 
458 aa  289  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0870  type III secretion system ATPase  42.82 
 
 
439 aa  289  7e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.388833  decreased coverage  0.00178442 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1243  flagellum-specific ATP synthase  41.55 
 
 
457 aa  289  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  44.58 
 
 
441 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  40.59 
 
 
439 aa  288  9e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  41.21 
 
 
439 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  42.21 
 
 
435 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1327  flagellum-specific ATP synthase  40.2 
 
 
446 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  40.91 
 
 
446 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 
446 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2011  flagellum-specific ATP synthase  39.73 
 
 
484 aa  287  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  39.13 
 
 
464 aa  288  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  43.49 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  39.9 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  39.9 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  39.9 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  42.82 
 
 
441 aa  286  5e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  39.9 
 
 
438 aa  286  5e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2293  flagellum-specific ATP synthase  39.5 
 
 
472 aa  286  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.673762  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  39.9 
 
 
445 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2394  flagellum-specific ATP synthase  39.28 
 
 
472 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.159626  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  43.6 
 
 
450 aa  286  7e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  41.18 
 
 
463 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  39.7 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  39.42 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  41.59 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  39.85 
 
 
427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  41.81 
 
 
442 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1185  flagellum-specific ATP synthase  40.74 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2934  FliI/YscN family ATPase  40.42 
 
 
547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  39.66 
 
 
445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>