More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2966 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  100 
 
 		 442 aa  880    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  60.19 
 
 		 436 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  59.95 
 
 		 436 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  58.88 
 
 		 444 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  58.35 
 
 		 436 aa  487  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  53.08 
 
 		 450 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4199  ATPase FliI/YscN  54.11 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  44.2 
 
 		 475 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  44.29 
 
 		 445 aa  345  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  47.31 
 
 		 455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  45.14 
 
 		 448 aa  336  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  40.96 
 
 		 454 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  41.07 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  40.92 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  41.51 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  41.06 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  40.27 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  43.79 
 
 		 445 aa  327  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  42.03 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  44.5 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  42.69 
 
 		 453 aa  319  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  43.4 
 
 		 451 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  43.4 
 
 		 451 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1114  flagellum-specific ATP synthase  41.94 
 
 		 426 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  42.92 
 
 		 452 aa  316  6e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  43.27 
 
 		 442 aa  312  5.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2006  flagellum-specific ATP synthase  42.14 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  40.1 
 
 		 437 aa  305  8.000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  41.1 
 
 		 443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0770  ATPase FliI/YscN  39.03 
 
 		 472 aa  303  5.000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.127902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  40 
 
 		 464 aa  302  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  41.37 
 
 		 451 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  44 
 
 		 439 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  42.82 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  42.23 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  42.56 
 
 		 466 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3098  ATPase, FliI/YscN family  42.39 
 
 		 443 aa  299  6e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  39.77 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  40.32 
 
 		 464 aa  298  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1334  ATPase, FliI/YscN family  40.46 
 
 		 441 aa  298  1e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.464634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  43.42 
 
 		 453 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  40.6 
 
 		 436 aa  296  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.98 
 
 		 474 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03159  flagellum-specific ATP synthase  41.29 
 
 		 439 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2305  flagellum-specific ATP synthase  47 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  42.79 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002818  flagellum-specific ATP synthase FliI  39.86 
 
 		 439 aa  293  3e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  39.58 
 
 		 431 aa  294  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0787  ATPase, FliI/YscN family  48.28 
 
 		 450 aa  293  4e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0712  flagellar protein export ATPase FliI  41.78 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  39.77 
 
 		 433 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1505  flagellum-specific ATP synthase  40.14 
 
 		 449 aa  292  9e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16860  flagellar protein export ATPase FliI  39.33 
 
 		 437 aa  292  9e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  38.22 
 
 		 470 aa  291  1e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  40 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  43.18 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 537 aa  291  1e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2405  flagellar protein export ATPase FliI  40.62 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1714  flagellum-specific ATP synthase  41.01 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  43.4 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  40.81 
 
 		 458 aa  290  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  40.57 
 
 		 480 aa  289  5.0000000000000004e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1161  flagellar protein export ATPase FliI  41.73 
 
 		 458 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.489016  normal  0.0133257 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2188  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.559151 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2130  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1270  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.855799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1147  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2135  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 456 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000819921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2532  flagellum-specific ATP synthase  39.22 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.634395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  38.61 
 
 		 444 aa  288  1e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  42.82 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  40.91 
 
 		 442 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  42.33 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  43.4 
 
 		 446 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04976  flagellum-specific ATP synthase  39.43 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0205  flagellum-specific ATP synthase  38.44 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0188  flagellum-specific ATP synthase  38.22 
 
 		 461 aa  286  5e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  41.25 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  39.21 
 
 		 438 aa  286  7e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  40.96 
 
 		 442 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1019  flagellar protein export ATPase FliI  39.34 
 
 		 466 aa  285  9e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0226  flagellum-specific ATP synthase  38.22 
 
 		 461 aa  285  9e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1877  ATPase, FliI/YscN family  47.34 
 
 		 461 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.23531  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0294  flagellar protein export ATPase FliI  37.04 
 
 		 436 aa  285  2.0000000000000002e-75  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0706  flagellar protein export ATPase FliI  40.53 
 
 		 427 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  44.05 
 
 		 446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  42.34 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  43.11 
 
 		 446 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  42.71 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0226  flagellum-specific ATP synthase  39.71 
 
 		 435 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00978  flagellum-specific ATP synthase  47.65 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06188  flagellum-specific ATP synthase  47.65 
 
 		 458 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0195618  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3562  ATPase, FliI/YscN family protein  37.05 
 
 		 436 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1543  ATPase, FliI/YscN family  37.41 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5939  type III secretion system ATPase  39.47 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.952292  normal  0.0674571 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  39.49 
 
 		 436 aa  282  7.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001189  flagellum-specific ATP synthase FliI  38.38 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0568  flagellar biosynthesis ATPase  40.29 
 
 		 487 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.722995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  39.53 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  44.95 
 
 		 446 aa  281  1e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>