More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0731 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0347  flagellum-specific ATP synthase  82.1 
 
 		 466 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0569948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0315  flagellum-specific ATP synthase  82.25 
 
 		 465 aa  740    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0253  flagellum-specific ATP synthase  77.51 
 
 		 467 aa  705    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.456391  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0731  flagellum-specific ATP synthase  100 
 
 		 464 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.978274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0300  flagellum-specific ATP synthase  55.48 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0656  flagellum-specific ATP synthase  55.77 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0682  flagellum-specific ATP synthase  55.66 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0693  flagellum-specific ATP synthase  55.66 
 
 		 442 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.11066  normal  0.120741 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1657  flagellum-specific ATP synthase  54.52 
 
 		 449 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6505  flagellum-specific ATP synthase  54.81 
 
 		 441 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0376524 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2811  flagellum-specific ATP synthase  54.57 
 
 		 442 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.710892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1145  flagellum-specific ATP synthase  51.89 
 
 		 537 aa  449  1e-125  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0120  flagellum-specific ATP synthase  52.82 
 
 		 453 aa  445  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4214  flagellum-specific ATP synthase  51.6 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1086  flagellum-specific ATP synthase  51.66 
 
 		 443 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.794753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1708  flagellum-specific ATP synthase  53.48 
 
 		 439 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.283596 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0129  flagellum-specific ATP synthase  48.83 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4232  flagellum-specific ATP synthase  48.41 
 
 		 441 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.160118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3370  flagellum-specific ATP synthase  47.24 
 
 		 454 aa  333  6e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2175  flagellum-specific ATP synthase  43.74 
 
 		 445 aa  332  7.000000000000001e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1023  flagellum-specific ATP synthase  47.42 
 
 		 445 aa  332  1e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.063887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0526  flagellum-specific ATP synthase  49.56 
 
 		 475 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.54892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3450  flagellum-specific ATP synthase  43.42 
 
 		 455 aa  326  7e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.493136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1392  ATPase, FliI/YscN family  48.29 
 
 		 441 aa  325  9e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3621  flagellum-specific ATP synthase  51.08 
 
 		 453 aa  325  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000764304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2109  FliI/YscN family ATPase  45.45 
 
 		 444 aa  325  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61014  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6532  flagellum-specific ATP synthase  43.99 
 
 		 440 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3671  flagellum-specific ATP synthase  47.74 
 
 		 441 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3911  flagellum-specific ATP synthase  47.89 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5574  flagellum-specific ATP synthase  48.98 
 
 		 450 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0225811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0746  flagellum-specific ATP synthase  49.13 
 
 		 452 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0823  flagellum-specific ATP synthase  50.61 
 
 		 451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.271511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0783  flagellum-specific ATP synthase  50.61 
 
 		 451 aa  320  3e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0526  flagellum-specific ATP synthase  48.22 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1823  flagellum-specific ATP synthase  49.1 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00582391  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1653  ATPase, FliI/YscN family  49.84 
 
 		 453 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0964744  normal  0.237468 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1690  flagellar protein export ATPase FliI  46.58 
 
 		 437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2170  ATPase, FliI/YscN family  43.83 
 
 		 431 aa  305  9.000000000000001e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3445  flagellar protein export ATPase FliI  43.82 
 
 		 443 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5264  flagellum-specific ATP synthase  44.47 
 
 		 486 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553459  normal  0.0874558 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2041  flagellar protein export ATPase FliI  49.7 
 
 		 436 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3947  flagellum-specific ATP synthase  50.16 
 
 		 451 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  0.0570906 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2966  ATP synthase FliI/YscN  40 
 
 		 442 aa  302  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.171951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0975  flagellar protein export ATPase FliI  44.31 
 
 		 435 aa  300  5e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.29671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5100  ATPase FliI/YscN  45.55 
 
 		 488 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.956813  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1332  H+-transporting two-sector ATPase, alpha/beta subunit  45.14 
 
 		 436 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.809736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0041  flagellar protein export ATPase FliI  47.45 
 
 		 489 aa  300  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.387405  normal  0.509252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1394  type III secretion system ATPase, FliI/YscN  42.12 
 
 		 439 aa  299  7e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.775691 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1994  flagellum-specific ATP synthase  44.04 
 
 		 463 aa  299  9e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0670  flagellum-specific ATP synthase  43.59 
 
 		 448 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.438164  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1482  flagellum-specific ATP synthase  40.95 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3246  flagellum-specific ATP synthase  42.14 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0205  flagellum-specific ATP synthase  40.28 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0758  flagellar protein export ATPase FliI  40.7 
 
 		 443 aa  296  5e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0226  flagellum-specific ATP synthase  40.24 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0188  flagellum-specific ATP synthase  40.24 
 
 		 461 aa  296  7e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.486749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4147  Peptidase C14, ICE, catalytic subunit p20, active site  44.39 
 
 		 433 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2599  FliI/YscN family ATPase  42.86 
 
 		 436 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.882891  hitchhiker  0.000211715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0001  FliI/YscN family ATPase  44.64 
 
 		 436 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2185  flagellum-specific ATP synthase  43.49 
 
 		 458 aa  293  4e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2344  ATPase, FliI/YscN family  47.26 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.654751  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0844  flagellar protein export ATPase FliI  43.66 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2085  flagellum-specific ATP synthase  40.47 
 
 		 436 aa  292  7e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2573  flagellum-specific ATP synthase  42.01 
 
 		 445 aa  292  8e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0852  Sodium-transporting two-sector ATPase  44.36 
 
 		 442 aa  292  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1364  flagellum-specific ATP synthase  41.4 
 
 		 446 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0730  flagellar protein export ATPase FliI  40 
 
 		 438 aa  292  1e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3976  FliI/YscN family ATPase  43.37 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0774  ATPase FliI/YscN  43.59 
 
 		 436 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3065  flagellum-specific ATP synthase  41.73 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.65037 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1440  flagellum-specific ATP synthase  41.73 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2903  ATPase, FliI/YscN family  44.54 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2923  flagellum-specific ATP synthase  41.73 
 
 		 445 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1269  flagellar protein export ATPase FliI  43.65 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.73816  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1285  flagellum-specific ATP synthase  41.36 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1352  flagellum-specific ATP synthase  41.36 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0849869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2933  flagellum-specific ATP synthase  41.73 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1345  flagellum-specific ATP synthase  41.12 
 
 		 445 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.446012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2294  flagellum-specific ATP synthase  41.5 
 
 		 446 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2988  ATPase, FliI/YscN family  43.86 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0295265 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3225  flagellum-specific ATP synthase  40.92 
 
 		 445 aa  290  4e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3063  flagellum-specific ATP synthase  41.44 
 
 		 446 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3473  FliI/YscN family ATPase  43.09 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.906241  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1621  flagellum-specific ATP synthase  42.23 
 
 		 446 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0080  FliI/YscN family ATPase  41.99 
 
 		 445 aa  289  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1218  flagellum-specific ATP synthase FliI  42.71 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1777  flagellum-specific ATP synthase  41.43 
 
 		 435 aa  288  1e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2356  flagellar biosynthesis/type III secretory pathway ATPase, FliI/YscN  43.39 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.721701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0419  flagellar protein export ATPase FliI  49.54 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1495  flagellum-specific ATP synthase  39.91 
 
 		 435 aa  287  2e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0074  FliI/YscN family ATPase  41.53 
 
 		 447 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2714  flagellar protein export ATPase FliI  42.34 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4658  FliI/YscN family ATPase  45.17 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.307886 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1348  ATPase FliI/YscN  45.67 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0174  flagellum-specific ATP synthase  44.12 
 
 		 435 aa  286  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3044  flagellum-specific ATP synthase  41.13 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2024  ATPase, FliI/YscN family  42.2 
 
 		 446 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4171  ATPase, FliI/YscN family  45.27 
 
 		 478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763526  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1695  flagellum-specific ATP synthase  42.43 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1369  flagellum-specific ATP synthase  41.1 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>